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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001675`

染色体: Chr01 坐标: 30902839-30904718 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001675`
名称	SmilChr01G001675
描述	transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30902839 - 30904718 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019903`
GeneID	`131019903`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019903`
原始查询	`LOC131019903`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like
产物	transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like
Arabidopsis	`AT2G28160` (FRU) FER-like regulator of iron uptake [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817362] identity=44; qcov=0.975; evalue=4.33e-73; confidence=medium
Rice	`Os04g0381700` (OsbHLH156) - identity=36.2; qcov=0.682; evalue=8.04e-32; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF23177 (bHLH_IRO3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019903

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804509.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804509.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804509.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804509.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804509.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30903135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B75
`Chr1:30903147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:30903199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C48
`Chr1:30903238`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B140
`Chr1:30903238`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B140
`Chr1:30903314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:30903320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B101
`Chr1:30903321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,C46,C47
`Chr1:30903859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B35,C68
`Chr1:30903975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:30904163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:30904208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C26,C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804509.1

324 aa

162

324

HLH

bHLH_IRO3

PF00010 HLH 146-190 aa PF23177 bHLH_IRO3 147-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804509.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	146	190	1.1e-09	38.7	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057804509.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	147	215	4.1e-07	31.0	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948526.1
ATGCTTTTCACACCATAATTTCATAATATAAATACCCCAAAAAATAAACAAGAATCTTCACACCAAGAAGAGAAAGAAAAGAAAATGGATAGGTTTGATGATGAAAACGGAGGGATCCCATTTCCCCAATATTATGCAAGTGAATTTGGTTTGATCGATTTCATGGATGAAGCCAATGTGGATCAGTTCATCGATCTCATTCGTGGAGAAAATATTCAAAATGATCAACCTATTTTCAACTTGTTCGATCAAGACTACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019903
ATGGATAGGTTTGATGATGAAAACGGAGGGATCCCATTTCCCCAATATTATGCAAGTGAATTTGGTTTGATCGATTTCATGGATGAAGCCAATGTGGATCAGTTCATCGATCTCATTCGTGGAGAAAATATTCAAAATGATCAACCTATTTTCAACTTGTTCGATCAAGACTACCAATACTGCCGCGGAGATGAGAGCATTCATGTCGCCGCCGCCGTTGAGGACTGCCATTTCCTTCCACCACCGCCGCCGCAGGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804509.1
MDRFDDENGGIPFPQYYASEFGLIDFMDEANVDQFIDLIRGENIQNDQPIFNLFDQDYQYCRGDESIHVAAAVEDCHFLPPPPPQAELFDFDAGHEFGLLNACEITQAEEEELLMDEDDQSSGSGTTTTATGSRSASGKADRSKTLVSERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVQDLQIQARKIRAEIAGFEEKTQHKKTTQNGSKSNSTTCFYPTTKKIFKMEVSQVEDRGFYVRIVANGGHSVAAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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