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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001921`

染色体: Chr04 坐标: 31294926-31299778 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001921`
名称	SmilChr04G001921
描述	serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31294926 - 31299778 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019905`
GeneID	`131019905`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019905`
原始查询	`LOC131019905`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform-like
产物	serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform-like
Arabidopsis	`AT1G17720` (ATB BETA) Protein phosphatase 2A, regulatory subunit PR55 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838348] identity=56.2; qcov=0.912; evalue=2.43e-173; confidence=high
Rice	`Os02g0224200` - identity=57.2; qcov=0.937; evalue=1.81e-175; confidence=high
GO	GO:0000159 (protein phosphatase type 2A complex); GO:0005515 (protein binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0019888 (protein phosphatase regulator activity); GO:0070262 (peptidyl-serine dephosphorylation)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04382 (Cornified envelope formation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019905

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804510.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804511.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057804511.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804510.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804510.1`

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EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31295351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C42
`Chr4:31296700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B46,C33
`Chr4:31296901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B32,B65,B76
`Chr4:31298079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:31298872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr4:31298923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B27,B57,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948527.1
TTTTATACTAAAATTCACAGTGGCGCTGACGCAGAACCTGAGAAAATTGACAATTGACGCTGCTGCTGGAGAATGTCGTTTTGAGCTGTCACCCCAACCGCCTATTAGCATGAGTTTTAGCTCGGACTCTTCTTCTTCGTCGCCGGCGGCCGCTATGGACTGGAAGTTCTCTCAGGTCTTCGGCGACAAACTGCCTGGAGAAGATGTTCGAGACATTGATGTTATTTCCGCAATTGAGTTCGACAAGAGTGGCGATCACT...

XM_057948528.1
AACCTGGTATGTCGTATTACAACATTTCAGCTGAAAATAATTGAGTGGATAACGGAAACCCAACACCCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTACCTCAGAGAAAATTGACAATTGACGCTGCTGCTGGAGAATGTCGTTTTGAGCTGTCACCCCAACCGCCTATTAGCATGAGTTTTAGCTCGGACTCTTCTTCTTCGTCGCCGGCGGCCGCTATGGACTGGAAGTTCTCTCAGGTCTTCGGCGACAAACTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019905
ATGAGTTTTAGCTCGGACTCTTCTTCTTCGTCGCCGGCGGCCGCTATGGACTGGAAGTTCTCTCAGGTCTTCGGCGACAAACTGCCTGGAGAAGATGTTCGAGACATTGATGTTATTTCCGCAATTGAGTTCGACAAGAGTGGCGATCACTTGGCCGTCGGCGATCGAGGCGGCCGCGTCGTCATTTTTCAGGACAACGGTGGTAACGATGCCTTAGTCCTGTCCACTCCGCGGAATGAGTTGGAGAGGCTTGATAGAGT...

LOC131019905
ATGTTCGAGACATTGATGTTATTTCCGCAATTGAGTTCGACAAGAGTGGCGATCACTTGGCCGTCGGCGATCGAGGCGGCCGCGTCGTCATTTTTCAGGACAACGGTGGCCTTAGTCCTGTCCACTCCGCGGAATGAGTTGGAGAGGCTTGATAGAGTTATTTCGAAGCATCCTAAATTTCAGTACAAAACAGAGTTCCAAAGTCACGAGCCAGAGTTTGATTATTTGAGGAGTGTTGAGATTGAAGAAAAGATCAATAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804510.1
MSFSSDSSSSSPAAAMDWKFSQVFGDKLPGEDVRDIDVISAIEFDKSGDHLAVGDRGGRVVIFQDNGGNDALVLSTPRNELERLDRVISKHPKFQYKTEFQSHEPEFDYLRSVEIEEKINKVRWCAASTGSLHILSSNDKTIKLWKVKDRQVKRVKEVDTSQPISSENSLLAEKSFINEQKSSFGNGHSLEWKENMGNGVFTYNGTHDKIACLEDASVSRSRRVYAHAHDFSINSISVNSDWETFLSGDDLRINLWNLEI...

XP_057804511.1
MFETLMLFPQLSSTRVAITWPSAIEAAASSFFRTTVALVLSTPRNELERLDRVISKHPKFQYKTEFQSHEPEFDYLRSVEIEEKINKVRWCAASTGSLHILSSNDKTIKLWKVKDRQVKRVKEVDTSQPISSENSLLAEKSFINEQKSSFGNGHSLEWKENMGNGVFTYNGTHDKIACLEDASVSRSRRVYAHAHDFSINSISVNSDWETFLSGDDLRINLWNLEISNQCFNIIDMKPVNMEDLIEVITAVEFHPSHCNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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