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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001912`

染色体: Chr04 坐标: 31218803-31220763 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001912`
名称	SmilChr04G001912
描述	protein RETICULATA-RELATED 3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31218803 - 31220763 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019909`
GeneID	`131019909`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019909`
原始查询	`LOC131019909`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RETICULATA-RELATED 3, chloroplastic-like
产物	protein RETICULATA-RELATED 3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G08640` (AT3G08640) alphavirus core family protein (DUF3411) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820011] identity=70.9; qcov=0.709; evalue=5.94e-129; confidence=high
Rice	`Os01g0812900` - identity=71.7; qcov=0.67; evalue=1.38e-117; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11891 (RETICULATA-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019909

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804516.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057804516.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804516.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804516.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804516.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31219477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr4:31219512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:31219670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr4:31220173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B135,B48,C37
`Chr4:31220241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:31220286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804516.1

358 aa

179

358

RETICULATA-like

PF11891 RETICULATA-like 119-286 aa

XP_057804517.1

358 aa

179

358

RETICULATA-like

PF11891 RETICULATA-like 119-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804516.1`	Pfam	`PF11891`	RETICULATA-like	Family	119	286	7.9e-64	215.4	Protein RETICULATA-related
`XP_057804517.1`	Pfam	`PF11891`	RETICULATA-like	Family	119	286	7.9e-64	215.4	Protein RETICULATA-related

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948533.1
TACGTGTTCGAATCTAGACGGAAGTGCGGACCGCTTAGCATTTAGGTGAGAGGGCGGGGCCCAGGACCAAGAGTGCCGGCCGCTATATAAATAAGTCACACCAACTCCTCTCTCAACAAGTGATGCACTATACACCTCTGCTACCTTGATGCGAGATACGATTTGCGGTTAGACGAGTGATCTCATTGATCTGTTTAGCAGTTTTTTAAGTGAGTATTGATGGCGGCGATGGCTCAGCTTCGCTTCTCCCCACTTGCGTG...

XM_057948534.1
GAGGTTCCATTCATAATTTTTCCCTATTTCCCATTTGTTTTGCAAGTAGCACATTATTTTGTTGACAATTTTTTACTTAGCTTTGATTCATATTATCTATTTCGTGCGATTGTGATGTCACTTCATAAGATTTTGTTTTTTGTTTTTTTCACTTCGAATACGATTTGCGGTTAGACGAGTGATCTCATTGATCTGTTTAGCAGTTTTTTAAGTGAGTATTGATGGCGGCGATGGCTCAGCTTCGCTTCTCCCCACTTGCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019909
ATGGCGGCGATGGCTCAGCTTCGCTTCTCCCCACTTGCGTGCCACTACAGCCGCCCCAGCTGTGGTCGTGAGTTTGCCAGTTTTGCCCCAATATTCGCCGATAATACTTCCGCGAGTTCTGTCTTCTTTCCTTCATTGAAATGCAGTGGAAATTTAATGGGGAGTCTTGATCTACAAAGTAAATTTCAATTACCATGTGCTGGAGGCGGTGGAGATATCGGCGTTGGACGAGGTAGTGGTGGAGATGATGGTGGAAATGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804516.1
MAAMAQLRFSPLACHYSRPSCGREFASFAPIFADNTSASSVFFPSLKCSGNLMGSLDLQSKFQLPCAGGGGDIGVGRGSGGDDGGNGGWSGGGGDSDESKSSSDSFGPIGAFLNGWRSRVAADPQFPFKVLMEELVGVSACCLGDMASRPNFGLNELDFVFSTLVVGSIMNFVLMYLLAPTMSSASISLPGIFASSPTSHMFEPGAYSVLSRLGTFVYKGTLFAAVGFAAGLVGTALSNGLIKMRKKMDPSFETPNKAPP...

XP_057804517.1
MAAMAQLRFSPLACHYSRPSCGREFASFAPIFADNTSASSVFFPSLKCSGNLMGSLDLQSKFQLPCAGGGGDIGVGRGSGGDDGGNGGWSGGGGDSDESKSSSDSFGPIGAFLNGWRSRVAADPQFPFKVLMEELVGVSACCLGDMASRPNFGLNELDFVFSTLVVGSIMNFVLMYLLAPTMSSASISLPGIFASSPTSHMFEPGAYSVLSRLGTFVYKGTLFAAVGFAAGLVGTALSNGLIKMRKKMDPSFETPNKAPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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