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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001920`

染色体: Chr04 坐标: 31290399-31291507 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001920`
名称	SmilChr04G001920
描述	glutathione S-transferase T2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31290399 - 31291507 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019912`
GeneID	`131019912`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019912`
原始查询	`LOC131019912`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase T2-like
产物	glutathione S-transferase T2-like
Arabidopsis	`AT1G66235` (AT1G66235) no-apical-meristem-associated carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842939] identity=34.4; qcov=0.918; evalue=1.17e-45; confidence=low
Rice	`Os06g0635500` - identity=26; qcov=0.616; evalue=5.07e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019912

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804519.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804519.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804519.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804519.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31290480`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B43,B51,C70
`Chr4:31290480`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B43,B51,C70
`Chr4:31290481`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B43,B51,C70
`Chr4:31290540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B18,C16,C66,C70
`Chr4:31290585`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B25,B91,C21,C38
`Chr4:31290585`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B25,B91,C21,C38
`Chr4:31290638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr4:31290782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:31290790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C50,C62
`Chr4:31290827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B38,B39,D5
`Chr4:31290827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,D5
`Chr4:31290828`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804519.1

294 aa

147

294

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 93-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804519.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	93	249	2e-16	61.9	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948536.1
AGCCTAATTACACAATCGATGAAGATAAACATCTTTGTCGTGTGTATATGGATCTATCCCAAGATGGTGAAACAGGAATCTATCAAAAAAAAGATACCTTTTGGAAAGAAATTGTGAACGTATATAATAGTGACAAACCTTCTCCACATATTCCTGATCGAACCAAAAGATCGCTTGAAACTCGTATGCAAGTCATTATGAGTTCTCTTTCAAAATTCAAAGGATGCGTGCAACAAATCGAATATCTAAATCCAAGTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019912
ATGGATCTATCCCAAGATGGTGAAACAGGAATCTATCAAAAAAAAGATACCTTTTGGAAAGAAATTGTGAACGTATATAATAGTGACAAACCTTCTCCACATATTCCTGATCGAACCAAAAGATCGCTTGAAACTCGTATGCAAGTCATTATGAGTTCTCTTTCAAAATTCAAAGGATGCGTGCAACAAATCGAATATCTAAATCCAAGTGGCGCTTCTGAAAAAGATATTTTTGATCGTGCAAAACAATTACTGACGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804519.1
MDLSQDGETGIYQKKDTFWKEIVNVYNSDKPSPHIPDRTKRSLETRMQVIMSSLSKFKGCVQQIEYLNPSGASEKDIFDRAKQLLTEDPRYKKGFKFEHVWPLMKDFVKFDCPSQRSSFQAETPPESPISPDGLSSFSINLSDGSGSGSGPTQRPDGVKKTKNKRKKGEDMSNILQAINQGNKRLEEIMDNSSTKKDQIMQLQQQKIEAKKQALAFRKWEADNKILMIDTDNISDPIRREYFKQEQTRIILKRQDGSGSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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