当前解析结果
SmilChr04G001953| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001953 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001953 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001953 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 31725225 - 31726735 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131019930 |
|---|---|
| GeneID | 131019930 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019930 |
| 原始查询 | LOC131019930 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019930 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057804534.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057804534.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057804534.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057804534.1 |
| 5 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057804534.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:31726072 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B112,B136,B66,C10,C55 |
Chr4:31726091 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,B35,D11 |
Chr4:31726109 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C17,C79 |
Chr4:31726114 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B50,C42 |
Chr4:31726120 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,C42 |
Chr4:31726269 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B37,B44,B81 |
Chr4:31726271 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B50,C42 |
Chr4:31726273 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B34,C7,C76,D1 |
Chr4:31726298 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B22 |
Chr4:31726316 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr4:31726332 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B117,B127,B32 |
Chr4:31726352 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。