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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001956`

染色体: Chr04 坐标: 31744718-31748661 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001956`
名称	SmilChr04G001956
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31744718 - 31748661 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019931`
GeneID	`131019931`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019931`
原始查询	`LOC131019931`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28.5; qcov=0.671; evalue=7.02e-71; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=32; qcov=0.613; evalue=5.86e-70; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019931

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804535.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804535.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804535.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804535.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31745437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:31745561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B133,B94
`Chr4:31745675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C67,C9,D7
`Chr4:31745739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:31745799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:31745918`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C73
`Chr4:31745918`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C73
`Chr4:31746035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B35,B41,C1,C23
`Chr4:31746172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A22,A23,A8,B107,B115,B121,B129,B131,B14,B15,B63,B78,B81,B89,C26,C33,C34,C37,C59,C71,C79,C84,C85,C87
`Chr4:31746404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:31746416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,D7
`Chr4:31746580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804535.1

1115 aa

558

1115

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 407-577 aa PF23559 WHD_DRP 662-730 aa PF23598 LRR_14 784-1088 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804535.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	407	577	1e-44	152.9	NB-ARC domain
`XP_057804535.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	662	730	4.2e-17	62.7	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057804535.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	784	1088	3.6e-21	76.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948552.1
CCTTCCTTGTCTTCTTGCTCCCGCACTCGCTCTCGCATAATAGAAGAAACTGTAGTAAAATATGATAAGGTCAACTTGGACCATTTCTTGATAACTCAGAAGGTCAACATAACAAAGTTGCATTTTACATTCATCGGTTACTCTTCCCAGAATACCTGCAGCCATTTTTCTCAGTTTTTGTGATTCCTTCAATTGCTGACTTTGCAAACTCTGGCAGTTTCCATTCCTTCTCAGGAATGTCGGCTTATGCGGCGCTGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019931
ATGTCGGCTTATGCGGCGCTGGTTTCTCTCCTCCAAATTCTGGCAACCATCCTTGATGGCGGCAGATCGTGGAGTATTCACAACCGAGCTCAGCTCCACTCCCTCCACGAAAAGGTCATTTTCTTTCTTGACTTTCTCGACAACTCTTCTACTTATAAGGCTACCCAGATATCAGCGCTAGAAACAAAGATGAGAGAGGCAGCTTACAGAGCAGAAGATCTTCTCCAATCCCAAATATCTCGCATTTCGGGTTCCGCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804535.1
MSAYAALVSLLQILATILDGGRSWSIHNRAQLHSLHEKVIFFLDFLDNSSTYKATQISALETKMREAAYRAEDLLQSQISRISGSASRRLRVLMVMTMINFLLSFAILRNWIDVSLPQAMPDWIKIFMLRILLPVLAAIPICTILAVVLNVALRESNFEEINGIRAQETQDLRLVLYDFNVMVKEVVRIKGARGRGDDDLDMSAYAALLSLRKILDSILESGEVRMSHNRAQIKSLHEKVTFLLDFLENTSAKSAPQIPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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