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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001957`

染色体: Chr04 坐标: 31767885-31769396 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001957`
名称	SmilChr04G001957
描述	probable carboxylesterase 18
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31767885 - 31769396 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019933`
GeneID	`131019933`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019933`
原始查询	`LOC131019933`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable carboxylesterase 18
产物	probable carboxylesterase 18
Arabidopsis	`AT5G23530` (CXE18) carboxyesterase 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832418] identity=46.2; qcov=0.951; evalue=4.41e-103; confidence=high
Rice	`Os07g0643400` (OJ1003_C06.126) - identity=45.7; qcov=0.957; evalue=7.39e-96; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF07859 (Abhydrolase_3); PF20434 (BD-FAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019933

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057804539.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057804539.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057804539.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804539.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804539.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31768315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B13,B35,C69
`Chr4:31768357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:31768411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C23
`Chr4:31768421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr4:31768436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B13,B35
`Chr4:31768444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:31768465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B46,C24
`Chr4:31768548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:31768890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804539.1

350 aa

175

350

BD-FAE

Abhydrolase_3

PF20434 BD-FAE 100-201 aa PF07859 Abhydrolase_3 107-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804539.1`	Pfam	`PF20434`	BD-FAE	Domain	100	201	4e-12	46.8	BD-FAE
`XP_057804539.1`	Pfam	`PF07859`	Abhydrolase_3	Domain	107	324	6.4e-54	183.6	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948556.1
TATATTTTAAAATTCTAATTCCGCTTCTGCATGCCCTCATCGAACGTGCTAACCTAAATTCCAAGAAAATCACAAAGTGCAAAAGTCGAACCCGTAAACCAACCAATCATATCTTCCCATTAATAATTGAAAGGTAGATGAGATTTATTAATGATGTAAGTAGCCCATCTCAAACTAGACCCCTCTTTCCAAGAAACACAAAAATGGCTTCGCTCCCATTGCTCACAAGATTGAAGCTCCTCATGTTCGACTTGATAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019933
ATGAGATTTATTAATGATGTAAGTAGCCCATCTCAAACTAGACCCCTCTTTCCAAGAAACACAAAAATGGCTTCGCTCCCATTGCTCACAAGATTGAAGCTCCTCATGTTCGACTTGATAACATACATGAGCACACGCCGCGACGGCAGCGTCAACCAGCTCCTCTTCCGCCTCGTAGACTCCAAAACATCGGCACCCGCCACCAAACGCATCAACACCGTCCGCGTCTCCACCTCAGACATCACAATCGACCCCTCCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804539.1
MRFINDVSSPSQTRPLFPRNTKMASLPLLTRLKLLMFDLITYMSTRRDGSVNQLLFRLVDSKTSAPATKRINTVRVSTSDITIDPSRNLWFRLFNPATPTSEPLPLIVYFHGGGFANYAPDTKHYSHLCCHLAAGTPAVVASVNYRLCPDHKYPTQYEDALDALKFIDAKCSDVLPANTDLARCFIGGDSAGGNIAHHVTVRFLEKMEQFDKMRIAGIIGLQPFFGGEERTESEVRLTKAPLLSVKQTDVYWRDFLPDGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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