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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001971`

染色体: Chr04 坐标: 31925539-31927847 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001971`
名称	SmilChr04G001971
描述	GDSL esterase/lipase At5g62930
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31925539 - 31927847 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019941`
GeneID	`131019941`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019941`
原始查询	`LOC131019941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At5g62930
产物	GDSL esterase/lipase At5g62930
Arabidopsis	`AT5G62930` (AT5G62930) SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836413] identity=66.7; qcov=0.988; evalue=1.46e-118; confidence=high
Rice	`Os10g0476700` (OsGELP109) - identity=64.7; qcov=0.979; evalue=1.86e-115; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL); PF13472 (Lipase_GDSL_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019941

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804549.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804549.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804549.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804549.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804549.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31925673`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B131
`Chr4:31925673`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B131
`Chr4:31925683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B14,B91
`Chr4:31925692`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A10,B101,B126,B133,B24,B37,B63,B85,B87,B94,B98,B99,C17,C44,C59,C80,C84,D11,D6
`Chr4:31926132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:31926647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr4:31926718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804549.1

243 aa

122

243

Lipase_GDSL

Lipase_GDSL_2

PF00657 Lipase_GDSL 5-202 aa PF13472 Lipase_GDSL_2 7-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804549.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	5	202	7.8e-32	111.8	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase
`XP_057804549.1`	Pfam	`PF13472`	Lipase_GDSL_2	Domain	7	199	1e-25	92.0	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948566.1
TTTTTTTGGAGAACGCCACACGAGATTTTCACTGAAAGAATGAAAGAAAAAGAATAATTATTGTAATACTAAAAAATTCAATTGGTTGAAGAACTTTAACCGTCACGACTCACATATAGCGCAGTTTGCATAACTTAACCGCGGCGGGGAAGAGAACTGAGAATGAGGCCTCAAATAGTGTTGTTTGGAGACTCCATAACGCAGCAATCTTTCAGATCGGGGGGTTGGGGCGCTTCTGTAGCTGACACATACTCAAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019941
ATGAGGCCTCAAATAGTGTTGTTTGGAGACTCCATAACGCAGCAATCTTTCAGATCGGGGGGTTGGGGCGCTTCTGTAGCTGACACATACTCAAGAAAGGTTGATGTAGTGCTTCGTGGGTATGGCGGCTACAACACTAGGTGGGCTCTCTTCTTGTTGCATCACCTATTCCCTCCGGTATCTGAAGCACCTTCTCCTGCTGCTGTTACCATATTTTTTGGGGCTAATGATGCTGCTCTTTTGGAGGGCACTGGCAAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804549.1
MRPQIVLFGDSITQQSFRSGGWGASVADTYSRKVDVVLRGYGGYNTRWALFLLHHLFPPVSEAPSPAAVTIFFGANDAALLEGTGKRQHVPLEEYKENLRKMVQHIKNHSPKTLVVLITPPPIDLEGRQEYARSMYGDKASKVADRTNEVAGTYADQCVALAKELCLPSINLWSKMQETNGWQRRFLSDGLHLTPEGNAVVFGELVKILDEAGFSALPYDFPLHSEIDEENPASSFSQDRATV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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