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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001976`

染色体: Chr04 坐标: 32021579-32022190 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001976`
名称	SmilChr04G001976
描述	uncharacterized SmilChr04G001976
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32021579 - 32022190 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019943`
GeneID	`131019943`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019943`
原始查询	`LOC131019943`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0256300` - identity=39.7; qcov=0.382; evalue=2.08e-10; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019943

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804552.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804552.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804552.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804552.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804552.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32021641`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C14,C74
`Chr4:32021641`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C14,C74
`Chr4:32021650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B81,B82,C1,C35,D5
`Chr4:32021675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	49	A10,A11,A18,A20,A3,B102,B105,B106,B108,B11,B124,B125,B140,B16,B17,B19,B20,B28,B48,B56,B6,B64,B65,B81,B88,B94,B96,C10,C14,C21,C24,C26,C34,C36,C39,C44,C5,C54,C59,C71,C72,C73,C80,C81,C82,C87,D1,D2,D4
`Chr4:32021721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C27,D5
`Chr4:32021755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A16,A2,A23,A25,A4,B18,B2,B26,B28,B30,B33,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B55,B57,B61,B67,B72,B80,B83,B84,B85,C30,C31,C37,C49,C57,C6,C62,C76,C77,C78,C83,D6,D8
`Chr4:32021759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr4:32022071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr4:32022072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804552.1

152 aa

152

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 30-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804552.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	30	74	3.6e-08	34.1	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948569.1
TGTAGGGTTTGTCGATGTTCTTCGTCTTCGATTAGATTCATGAGTTTCAATACAGTTTCCGGTGGGAATTCGTCGAGCTCATGGAGCAGTCGACGTCAGTGCGATGAATGGGAGAATAATCCAAAGTTTTGTGCGTGCGAAGGTAAAAAGTGTAGGGCTTCCTTGATGACATCATGGACAGATGATAACCCCGGTAGGAGGTTCTACGGTTGTCGGAATTGGAAGACAAAAAATTGTGGTTATTTTGATTGGATGGACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019943
ATGAGTTTCAATACAGTTTCCGGTGGGAATTCGTCGAGCTCATGGAGCAGTCGACGTCAGTGCGATGAATGGGAGAATAATCCAAAGTTTTGTGCGTGCGAAGGTAAAAAGTGTAGGGCTTCCTTGATGACATCATGGACAGATGATAACCCCGGTAGGAGGTTCTACGGTTGTCGGAATTGGAAGACAAAAAATTGTGGTTATTTTGATTGGATGGACGAACCTATGAGTGAAAGAGCAAAGGAAGTTATCAATGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804552.1
MSFNTVSGGNSSSSWSSRRQCDEWENNPKFCACEGKKCRASLMTSWTDDNPGRRFYGCRNWKTKNCGYFDWMDEPMSERAKEVINDLKRENLKLLKFKESSRSSIDVDSEIAKLWDVLQALKEESRKIRKKSRFMTYILLGSWLMFVYFALA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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