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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001686`

染色体: Chr01 坐标: 31086192-31089569 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001686`
名称	SmilChr01G001686
描述	50S ribosomal protein L9, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31086192 - 31089569 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019953`
GeneID	`131019953`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019953`
原始查询	`LOC131019953`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L9, chloroplastic
产物	50S ribosomal protein L9%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G44890` (RPL9) ribosomal protein L9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823623] identity=71.5; qcov=0.81; evalue=1.12e-88; confidence=high
Rice	`Os02g0822600` (OJ1119_A01.23-1) - identity=70.6; qcov=0.648; evalue=1.53e-80; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01281 (Ribosomal_L9_N); PF03948 (Ribosomal_L9_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019953

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804569.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804569.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804569.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804569.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804569.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31088600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B63,C56
`Chr1:31088608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:31089067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B130,C51
`Chr1:31089087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B130,C51
`Chr1:31089454`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B123,B125,B138,B85,B87,C41,D3
`Chr1:31089484`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B23,C25
`Chr1:31089484`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B23,C25
`Chr1:31089489`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	80	A1,A16,A18,A2,A24,A3,A4,A7,A8,A9,B104,B105,B109,B11,B119,B121,B128,B129,B133,B17,B18,B19,B23,B28,B30,B38,B39,B44,B48,B49,B56,B58,B59,B61,B65,B67,B72,B80,B83,B84,B88,B89,B9,B91,B93,B94,B96,C1,C10,C11,C18,C19,C22,C27,C29,C31,C35,C38,C39,C4,C42,C46,C49,C50,C52,C53,C55,C59,C69,C73,C75,C79,C8,C82,C83,C85,D2,D3,D5,D8
`Chr1:31089518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804569.1

247 aa

124

247

Ribosomal_L9_N

Ribosomal_L9_C

PF01281 Ribosomal_L9_N 101-146 aa PF03948 Ribosomal_L9_C 163-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804569.1`	Pfam	`PF01281`	Ribosomal_L9_N	Domain	101	146	3e-18	65.8	Ribosomal protein L9, N-terminal domain
`XP_057804569.1`	Pfam	`PF03948`	Ribosomal_L9_C	Domain	163	245	7.5e-21	75.1	Ribosomal protein L9, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100557.1
ACAATTTGAACTTGGGCTTTGGCGCTTAAAATATGGGCCGGCCCATATATTCACCATCTTCACAGCAACTACAGTCTAAAGCGAAGAAGTCGGATAATGGGATAAGAATAAGATTGGTTGAATGCAACTGCAGCAACTCTTACTCTAGTGACCAAAACTGCAAATTCTGTAATATCTTTGCGCCAATGGCTTCCACAAGTCTTTCATGGACTTCATCTTCATGGCTCCAGAACCACAGCTTCTCCAAGAACAGCACCGCA...

XM_057948586.1
ACAATTTGAACTTGGGCTTTGGCGCTTAAAATATGGGCCGGCCCATATATTCACCATCTTCACAGCAACTACAGTCTAAAGCGAAGAAGTCGGATAATGGGATAAGAATAAGATTGGTTGAATGCAACTGCAGCAACTCTTACTCTAGTGACCAAAACTGCAAATTCTGTAATATCTTTGCGCCAATGGCTTCCACAAGTCTTTCATGGACTTCATCTTCATGGCTCCAGAACCACAGCTTCTCCAAGAACAGCACCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019953
ATGGGCCGGCCCATATATTCACCATCTTCACAGCAACTACAGTCTAAAGCGAAGAAGTCGGATAATGGGATAAGAATAAGATTGGTTGAATGCAACTGCAGCAACTCTTACTCTAGTGACCAAAACTGCAAATTCTGTAATATCTTTGCGCCAATGGCTTCCACAAGTCTTTCATGGACTTCATCTTCATGGCTCCAGAACCACAGCTTCTCCAAGAACAGCACCGCAGACGCCGCCAAAACTGTCGACGGAGCTTCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804569.1
MGRPIYSPSSQQLQSKAKKSDNGIRIRLVECNCSNSYSSDQNCKFCNIFAPMASTSLSWTSSSWLQNHSFSKNSTADAAKTVDGASLLSVVAQKKAKKLRKVILKEDVTAVGKKGQLMDVKAGYFRNYLLPLGMAQIVTPQLIKEMKMEDERIEAEKKRVKDEAQQLATIFETVGAFKVKRKGGKGKQIFGSVTAQDLVDIIKAQLQRDVDKRIVSLPEIRETGEYVAELKLHPDVTARVRVTVYAN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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