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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001994`

染色体: Chr04 坐标: 32237019-32241429 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001994`
名称	SmilChr04G001994
描述	mitogen-activated protein kinase kinase 3
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32237019 - 32241429 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019960`
GeneID	`131019960`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019960`
原始查询	`LOC131019960`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase kinase 3
产物	mitogen-activated protein kinase kinase 3
Arabidopsis	`AT5G40440` (MKK3) mitogen-activated protein kinase kinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834042] identity=75.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0473200` (OsMKK3) - identity=68.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000165 (MAPK cascade); GO:0004708 (MAP kinase kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019960

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804580.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804580.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057804580.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804580.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804580.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32237499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:32237564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C42
`Chr4:32237576`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C84
`Chr4:32237576`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C84
`Chr4:32237689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:32237722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:32239048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:32239561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B41,B58,B99,C76
`Chr4:32239858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B53
`Chr4:32240623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,C1,C23,C72
`Chr4:32240663`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C84
`Chr4:32240663`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804580.1

521 aa

260

521

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 89-342 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 91-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804580.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	89	342	2.6e-58	198.2	Protein kinase domain
`XP_057804580.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	91	338	1.1e-33	117.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948597.1
CAACGGTTTACCCGAGTGCAACGCACTACTCGAGGAGGCGCTCGAGTAGCTGCGTTGCAGGTGCTCTAAAAGCTTAGGTAATTGGTCAATTATATAATTTCAAAATGGGAAATGGAGTTTAGGCGTCCTTCAACCTTAAGGATTATGGAGTATATAATTTGCATTTAATGGCGCCCGCCCAGAAAGAAAATTGTTTAAAATTGGATACTAAAGTGATGGTTATTTGATCATAAATCATCAAAATGATAAAACTAGCTAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019960
ATGGCTGGATTGGAAGAGTTGAAGAAGAAGCTCGTGCCACTCTTTGATGCAGAGAAAGGGTTCCCATCTGGGTCAACAATCGACCCTTCCGACTCTTACATGTTGTCGGATGGTGGAACAGTGAATCTACTGAGCAAATCATACAATATCTACAACATCAATGAACTGGGCCTGCAGAAATGCAGCTCATCTTCTTCTCCTTCTGCATTTTCTGTTGATGATGGGGAGAAAACATACAGGTGTGCTTCTCATGAGATGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804580.1
MAGLEELKKKLVPLFDAEKGFPSGSTIDPSDSYMLSDGGTVNLLSKSYNIYNINELGLQKCSSSSSPSAFSVDDGEKTYRCASHEMRVFGSIGSGASSVVQRAIHIPNHRIIALKKINIFEKEKRQQLLTEIRTLCEAPCYEGLVQFYGAFYTPDSGQISIALEYMDGGSLADILRIRKTIPEPVLSIMVQKLLIGLSYLHGVRHLVHRDIKPANLLVNLKGEPKITDFGISAGLEDSMAMCATFVGTVTYMSPERIRNE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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