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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001995`

染色体: Chr04 坐标: 32247435-32248851 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001995`
名称	SmilChr04G001995
描述	uncharacterized SmilChr04G001995
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32247435 - 32248851 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019961`
GeneID	`131019961`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019961`
原始查询	`LOC131019961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0639600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0639600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G62770` (AT5G62770) membrane-associated kinase regulator, putative (DUF1645) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836398] identity=30.8; qcov=1.06; evalue=2.11e-26; confidence=low
Rice	`Os01g0639600` - identity=39.6; qcov=0.796; evalue=3.59e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07816 (DUF1645)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019961

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804581.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057804581.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057804581.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804581.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804581.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32247847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:32247883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:32248042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C85
`Chr4:32248110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B65,B77,C67
`Chr4:32248160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:32248221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr4:32248243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B41,C85
`Chr4:32248261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:32248442`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B99
`Chr4:32248442`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B99
`Chr4:32248615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804581.1

314 aa

157

314

DUF1645

PF07816 DUF1645 107-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804581.1`	Pfam	`PF07816`	DUF1645	Family	107	266	2.2e-24	87.8	Protein of unknown function (DUF1645)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948598.1
CTTTCTCTTTATGATGACTCTCCCTATCTCTCTCTCTCTACTTTTTTGTACGTATTAAAAAGCGCTCTCTCTCTCTCTATTATTCACAGCCATTCACAAATATAAACTCCCACATTGCTAATCCCCACACTTTCCGCCATTTCAACCAACCATCTGCTCCCTCAAACTTGAAAATTTTCTGCCATTTCGAAGCAAAAATTTCTATGTAATAGTGTTTATTTCGGAATTAAACAACTTTTGAAGGTGATTTTTCAGAGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019961
ATGCAGGCGAGTTCTGCAATATCGCTCTCTCCCAGCTTCAACAGCTATTCCAACAGTAAACTGGCCGAAATCGCCGCGCGCGTCGTCGAAGAGTTCGGCTCTCAGGAACTCTACGACGAGGATTTTTACTTCGAGAGGGAGGAAAACTCGGCGACTCGACAATCGGAGGAAGGAGCGAATCCTGATTTTGTGAAGAATAGCGTTGAGGAAGGAGATTGTGAGTATGTAGAAAGTGAAAGAGAAAATCGTGTTGACGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804581.1
MQASSAISLSPSFNSYSNSKLAEIAARVVEEFGSQELYDEDFYFEREENSATRQSEEGANPDFVKNSVEEGDCEYVESERENRVDDDEEFEFAFVTRDSELPSPISADEIFHNGQIRPVYPVFNRDLFLESLEFPRENRKDEKGDGREKAPTIRLPLRKLFNEERETTMTMTTTSSCSSSDADELDGVPTESYCVWRPKEAAEEGRCKKSSSTGSNSKRWKFRVKDLLNRSHSEGSKDDFVILSPSNSGRKKQNEDRGKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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