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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001542`

染色体: Chr04 坐标: 25478118-25480232 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001542`
名称	SmilChr04G001542
描述	uncharacterized SmilChr04G001542
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25478118 - 25480232 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019981`
GeneID	`131019981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019981`
原始查询	`LOC131019981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication factor C subunit, putative (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830469]; symbol=AT5G05840; hit=AT5G05840; species=arabidopsis; confidence=high
产物	replication factor C subunit, putative (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830469]; symbol=AT5G05840; hit=AT5G05840; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G05840` (AT5G05840) replication factor C subunit, putative (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830469] identity=55.8; qcov=0.944; evalue=2.46e-148; confidence=high
Rice	`Os03g0267500` - identity=52.6; qcov=1.07; evalue=2.46e-145; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04788 (DUF620)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057804601.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057804601.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057804601.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804601.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804601.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25478354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B7
`Chr4:25478391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B42,B7,C41
`Chr4:25478403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42
`Chr4:25478410`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A16,A3,A5,B107,B126,B138,B31,B39,B57,B58,B7,B72,B98,C29,C4,C45
`Chr4:25478446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:25478484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C36
`Chr4:25478488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr4:25478566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	233	A1,A10,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr4:25478581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr4:25478621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A14,A21,A8,B105,B17,B2,B46,B93,C16,C21,C3,C32,C43,C49,C60,C68,C71,C73,C82,C85,C86,D8
`Chr4:25478635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C16
`Chr4:25478667`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A8,B1,B38,B39,B57,C35,C54,C56,C74,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804601.1

412 aa

206

412

DUF620

PF04788 DUF620 120-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804601.1`	Pfam	`PF04788`	DUF620	Domain	120	361	3.2e-108	361.5	Protein of unknown function (DUF620)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948618.1
CATATAAAGATTGAGCCGCGCGGCCATCACACTCACGTTGTCTTCACTTTTCCCTCATCTTTATTACATACACACACCAAACTCAAAACCAACACACATTCTTCTTCTTCTTCTTCAATGAGAACCTTGTGGCCCAACCTCGCCGGAGACGACGGCCTCGAGACGGTCCTCGAGGTCCCCATCCCCGACGAGATGTTCGCTGCCTCCTCCAACTCCGGCAAGTCATGGCGGGCCATCAGAACCTGGCTCAAGAGCCCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019981
ATGAGAACCTTGTGGCCCAACCTCGCCGGAGACGACGGCCTCGAGACGGTCCTCGAGGTCCCCATCCCCGACGAGATGTTCGCTGCCTCCTCCAACTCCGGCAAGTCATGGCGGGCCATCAGAACCTGGCTCAAGAGCCCCCGGCCTTCGCTCGACTACGAGAGGCGCGCCGTTGAGATTCAGTTCTTGCTCGGCGTCATCGGAGCTCCCTTGCTCCCTCTCCCACTCTCCTGTTCTCATTCTCTCTATGATCGCAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804601.1
MRTLWPNLAGDDGLETVLEVPIPDEMFAASSNSGKSWRAIRTWLKSPRPSLDYERRAVEIQFLLGVIGAPLLPLPLSCSHSLYDRNIKAHPIEKSMASYIVQQYVAASGGEHALNSIESMCAVGKVKMAAADLSSDIRKIKSMKKGAGELGGFVLWQKSPALWSLELMLSGFKISAGCDGNVAWRQTPWQHSRASRGPPRPLRRSLQGLDPRGTADLFSNSICTGEKTINGDDCFVLKLEAESSTLMARSSSNAEINRHT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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