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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001553`

染色体: Chr04 坐标: 25729850-25733675 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001553`
名称	SmilChr04G001553
描述	proline transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25729850 - 25733675 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019986`
GeneID	`131019986`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019986`
原始查询	`LOC131019986`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proline transporter 1-like
产物	proline transporter 1-like
Arabidopsis	`AT2G39890` (PROT1) proline transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818576] identity=72.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0100800` (OsProT3) - identity=70.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019986

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804606.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057804606.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057804606.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804607.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804607.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25730207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:25730259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42
`Chr4:25731018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B65
`Chr4:25731214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:25731271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B65
`Chr4:25732905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:25733220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B90,B92,C58,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804606.1

480 aa

240

480

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 71-464 aa

XP_057804607.1

447 aa

224

447

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 38-431 aa

XP_057804608.1

383 aa

192

383

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 1-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804606.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	71	464	2.7e-85	287.2	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057804607.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	38	431	2.1e-85	287.6	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057804608.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	1	367	9.2e-80	269.0	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948623.1
CAACAACACTCCCTTTAAAAACAGAAATAAATAAATGAAAACAAAAATAAAACAACAACATTAATTCAAAAAAAAAAAAATACTCGTTCGTAGTTTACTTGTCAAAGCATATTTACCAAATTTCTTATTTCGGTTTTCAAAAAAGTAGCTATGAAATCAGCAAGTTGCGTAGACGGATGACGAGTTCTGACATGAAACCATAAGTTTTGGAAATTGCGTAACTTCCAGCTGCATACCCAAAAACAAAGATTTTTTTTTTT...

XM_057948624.1
AACAACACTCCCTTTAAAAACAGAAATAAATAAATGAAAACAAAAATAAAACAACAACATTAATTCAAAAAAAAAAAAATACTCGTTCGTAGTTTACTTGTCAAAGCATATTTACCAAATTTCTTATTTCGGTTTTCAAAAAAGTAGCTATGAAATCAGCAAGTTGCGTAGACGGATGACGAGTTCTGACATGAAACCATAAGTTTTGGAAATTGCGTAACTTCCAGCTGCATACCCAAAAACAAAGATTTTTTTTTTTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131019986
ATGGTGTTTGATGATGGTTTTAAAGGTGGGTTGCGCCTCAATTCAGGCCTGACGGCTGACGGCGGAGATATAACATCGGCACTTTTGAGAGGCGAGGAAATGGTCGTTGCTCCGGAATCAAACGACGCCGTTTCGGGCGGCTCTGGCTCTGCCTATTCTTCTAAGGATTCTGTGATTGTTGACATTTCTGACACCGCCCATCAAATTAGTCAAGATTCGTGGTTCCAGGTGGCGTTTGTCCTTACAACGGGGATAAACAG...

LOC131019986
ATGGTCGTTGCTCCGGAATCAAACGACGCCGTTTCGGGCGGCTCTGGCTCTGCCTATTCTTCTAAGGATTCTGTGATTGTTGACATTTCTGACACCGCCCATCAAATTAGTCAAGATTCGTGGTTCCAGGTGGCGTTTGTCCTTACAACGGGGATAAACAGTGCATATGTGTTGGGATACTCTGGCACTATTATGGTACCGTTGGGTTGGATTGGTGGTGTGGTCGGGCTAATTTTAGCAACAGCGATATCTTTGTATGC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804606.1
MVFDDGFKGGLRLNSGLTADGGDITSALLRGEEMVVAPESNDAVSGGSGSAYSSKDSVIVDISDTAHQISQDSWFQVAFVLTTGINSAYVLGYSGTIMVPLGWIGGVVGLILATAISLYANMLVAKLHEYGGRRHIRYRDLAGFMYGDEAYSLTWALQYVNLFMINVGYIILAGSALKALYALFQEESGMKLPHCIAVSGFACILFAIAVPHLSALRAWLAFSTVFSTVYIVTAFVLALKDGVEAPPRDYSIHGTTTSKI...

XP_057804607.1
MVVAPESNDAVSGGSGSAYSSKDSVIVDISDTAHQISQDSWFQVAFVLTTGINSAYVLGYSGTIMVPLGWIGGVVGLILATAISLYANMLVAKLHEYGGRRHIRYRDLAGFMYGDEAYSLTWALQYVNLFMINVGYIILAGSALKALYALFQEESGMKLPHCIAVSGFACILFAIAVPHLSALRAWLAFSTVFSTVYIVTAFVLALKDGVEAPPRDYSIHGTTTSKIFTTIGASANLVFAFNTGMLPEIQATVRQPVVDN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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