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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001564`

染色体: Chr04 坐标: 25941795-25944399 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001564`
名称	SmilChr04G001564
描述	protein ZW2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25941795 - 25944399 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019998`
GeneID	`131019998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019998`
原始查询	`LOC131019998`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ZW2-like
产物	protein ZW2-like
Arabidopsis	`AT1G58330` (ZW2) transcription factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842202] identity=31.4; qcov=1.02; evalue=1.94e-35; confidence=low
Rice	`Os01g0306400` (OsDOG1L-1) - identity=32.4; qcov=0.986; evalue=5.81e-29; confidence=low
GO	GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF14144 (DOG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804616.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057804616.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057804616.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804616.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804616.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25942009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:25942024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B140
`Chr4:25942044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B33
`Chr4:25942166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:25942178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:25942222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B22,B49,C71
`Chr4:25942226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A1,A19,B122,B13,B132,B22,B23,B29,B30,B5,B55,B56,B59,B60,B70,B72,B82,C1,C27,C35,C39,C41,C83,C84,D4
`Chr4:25942231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:25942399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B100,B22,B49,C71
`Chr4:25942420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr4:25942455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:25942484`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B35,B95,B99,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804616.1

219 aa

110

219

DOG1

PF14144 DOG1 36-95 aa

XP_057804617.1

219 aa

110

219

DOG1

PF14144 DOG1 36-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804616.1`	Pfam	`PF14144`	DOG1	Family	36	95	2.7e-20	73.0	Seed dormancy control
`XP_057804617.1`	Pfam	`PF14144`	DOG1	Family	36	95	2.7e-20	73.0	Seed dormancy control

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948633.1
CGCCGCCGAACTTCCTTAAGAGCTAATCCATCTTCCAAACATGAGCTATATATATAACACGATCAAGATCAACATGTTACTTCAAGCCCATCTCAAAAAACAAAACAAAAATGGTAGAGACAAACCATCAAACATTCGGAGCCTTTTTCGAGCAGTGGATTATCCGTCAGGAGCACTATCTCCGGCTGCTCCTCCGCGAAATGGACAGCGGCGGCGGACACTGCAGCGACCTCATCAATCAAGTCACGCGTCACTACGCC...

XM_057948634.1
CGCCGCCGAACTTCCTTAAGAGCTAATCCATCTTCCAAACATGAGCTATATATATAACACGATCAAGATCAACATGTTACTTCAAGCCCATCTCAAAAAACAAAACAAAAATGGTAGAGACAAACCATCAAACATTCGGAGCCTTTTTCGAGCAGTGGATTATCCGTCAGGAGCACTATCTCCGGCTGCTCCTCCGCGAAATGGACAGCGGCGGCGGACACTGCAGCGACCTCATCAATCAAGTCACGCGTCACTACGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019998
ATGGTAGAGACAAACCATCAAACATTCGGAGCCTTTTTCGAGCAGTGGATTATCCGTCAGGAGCACTATCTCCGGCTGCTCCTCCGCGAAATGGACAGCGGCGGCGGACACTGCAGCGACCTCATCAATCAAGTCACGCGTCACTACGCCCAGTACTTCGAGGCCAAGGCAAGAGCTGTGGAAGAAGATGTGTTTCTAGTGCTTGCGCCAACGTGGCTTAGCTTGTTCGAGAGATCGTATCTGTGGGTGGGCGGATTCAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804616.1
MVETNHQTFGAFFEQWIIRQEHYLRLLLREMDSGGGHCSDLINQVTRHYAQYFEAKARAVEEDVFLVLAPTWLSLFERSYLWVGGFRPGMVLCLVGSNVSDLGDDQSQRIRRLMSETQEEEREIMDELNRVQEEMVSSTMMQVTRHMQNGEKDELESAIDRLKVSMQRVVECADLLRRKTAVIMLEILNPTQAVKFLAAVATLQLSLRKWGMRSDVHKA

XP_057804617.1
MVETNHQTFGAFFEQWIIRQEHYLRLLLREMDSGGGHCSDLINQVTRHYAQYFEAKARAVEEDVFLVLAPTWLSLFERSYLWVGGFRPGMVLCLVGSNVSDLGDDQSQRIRRLMSETQEEEREIMDELNRVQEEMVSSTMMQVTRHMQNGEKDELESAIDRLKVSMQRVVECADLLRRKTAVIMLEILNPTQAVKFLAAVATLQLSLRKWGMRSDVHKA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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