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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001570`

染色体: Chr04 坐标: 26024286-26026852 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001570`
名称	SmilChr04G001570
描述	endoglucanase 13-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26024286 - 26026852 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020005`
GeneID	`131020005`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020005`
原始查询	`LOC131020005`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoglucanase 13-like
产物	endoglucanase 13-like
Arabidopsis	`AT2G44550` (GH9B10) glycosyl hydrolase 9B10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819063] identity=60.5; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0212300` (OsGH9C4) - identity=56.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00759 (Glyco_hydro_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020005

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057804621.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057804621.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057804621.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804621.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804621.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26024873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B30,B31,B39
`Chr4:26024883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B30,B31,B39
`Chr4:26024912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B30,B31,B39
`Chr4:26024913`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B18,B30,B31,B39
`Chr4:26024913`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B18,B30,B31,B39
`Chr4:26024914`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B18,B30,B31,B39
`Chr4:26024914`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B18,B30,B31,B39
`Chr4:26024953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:26025113`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C11,C69
`Chr4:26025113`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:26025170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B36,C33,C42,C71
`Chr4:26025190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804621.1

481 aa

240

481

Glyco_hydro_9

PF00759 Glyco_hydro_9 24-476 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804621.1`	Pfam	`PF00759`	Glyco_hydro_9	Repeat	24	476	1.1e-166	556.3	Glycosyl hydrolase family 9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948638.1
TTTAGTTGCAATATAATCTTAAGCTTGCAACTATGTCTAAGTTGTGCCTCTTTTTAGCAATATTTGGATTGTCTCAAATCCAAAATGCGGTTTCATACGATTATGGAGCTGCCCTAACTAAATCATTGTTGTTCTATGAAGCACAAAGGTCAGGGAAGTTGCCTTCTAACCAGAGACTCAAGTGGAGAGGAGATTCTGGACTTAGCGATGGCAACGCCGCTGGGGTGAATCTGGTGGGCGGATACTACGACGCCGGAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020005
ATGTCTAAGTTGTGCCTCTTTTTAGCAATATTTGGATTGTCTCAAATCCAAAATGCGGTTTCATACGATTATGGAGCTGCCCTAACTAAATCATTGTTGTTCTATGAAGCACAAAGGTCAGGGAAGTTGCCTTCTAACCAGAGACTCAAGTGGAGAGGAGATTCTGGACTTAGCGATGGCAACGCCGCTGGGGTGAATCTGGTGGGCGGATACTACGACGCCGGAGACAACGTGAAATTTGGGTTTCCGATGGCATACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804621.1
MSKLCLFLAIFGLSQIQNAVSYDYGAALTKSLLFYEAQRSGKLPSNQRLKWRGDSGLSDGNAAGVNLVGGYYDAGDNVKFGFPMAYTVTMLAWSAVEFGPHLGARHELSNALAAIKWGTDYLMKAHPQPDVLYGEVGDGGSDHSCWQRPEDMTTPRTVYKIDDQHPGSDLAGETAAALAAAALAFRHSNPGYSSQLITHAKQLFEFATKHTGVYQNSIPAAGQFYSSSGYEDELLWAAAWLREATKDERYLEFIKSANSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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