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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001571`

染色体: Chr04 坐标: 26062965-26070875 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001571`
名称	SmilChr04G001571
描述	peroxisome biogenesis protein 19-2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26062965 - 26070875 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020006`
GeneID	`131020006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020006`
原始查询	`LOC131020006`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxisome biogenesis protein 19-2
产物	peroxisome biogenesis protein 19-2
Arabidopsis	`AT3G03490` (PEX19-1) peroxin 19-1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821248] identity=64.1; qcov=1; evalue=2.52e-89; confidence=high
Rice	`Os02g0661000` - identity=62.9; qcov=0.899; evalue=1.64e-77; confidence=high
GO	GO:0005777 (peroxisome); GO:0005778 (peroxisomal membrane); GO:0033328 (peroxisome membrane targeting sequence binding); GO:0045046 (protein import into peroxisome membrane)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04614 (Pex19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804622.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804622.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057804622.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057804622.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057804623.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26064837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B55,C23
`Chr4:26064945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr4:26064948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,D7
`Chr4:26065032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr4:26069887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C1,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804622.1

252 aa

126

252

Pex19

PF04614 Pex19 65-252 aa

XP_057804623.1

198 aa

198

Pex19

PF04614 Pex19 11-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804622.1`	Pfam	`PF04614`	Pex19	Family	65	252	7.3e-40	138.0	Pex19 protein family
`XP_057804623.1`	Pfam	`PF04614`	Pex19	Family	11	198	1.1e-39	137.4	Pex19 protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948639.1
AAAAGCCATTCTTAATTAAAATAAGCGACACCGCTCGACCACTCGACCTCCTTTTTCTTTCTCTCTCTTCCTTGAAGTCTAGCCCTGTTTTTGCCGGCGCACCGCCCTCTCTCTGCCGCCGCCGTTCATCATTTTCAGCGGCTGCTGGAGCAAATTTAAGAAACTTGAACGAAAGGCAGCACCAATTGATCGAGGAGTTGATAAGGGGCTGCTGCAGGAGCGTCGGCCTGAACTGAAAGGTTGAACCAGAGGATCAAACT...

XM_057948640.1
TCCAGAGCCTTAATCTCACATCTTCTGTTCAAAGGGTTAGGGATGGGGTTGCCTGATTTGAAAATCAAGAAAAAGGGTAAACAAAAGGTACAACCATCGAAGCGAGAATCACACATTACGGAAGCACTTGATCAGCTGAGAGAGCAAACTAGGGAGGCGGTGAAAGGGTTGGAATCGGTGTCTGGGCCTCGACCCCCAATGGCTGGAGATGGCTTTGGTGGAGACCCGATGATGGAGGATTGGGTCAAGCAGTTTGAGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020006
ATGGCTGACCACTCCGACGATATAGACCAACTTCTTGACAGTGCTTTGGATGATTTCCAGAGCCTTAATCTCACATCTTCTGTTCAAAGAGGTGTGGATGATAATGGTTATAAAAATGGAGAGGGTTGTTCATTGACTAGTGGAAACGTTCAAGGGTTAGGGATGGGGTTGCCTGATTTGAAAATCAAGAAAAAGGGTAAACAAAAGGTACAACCATCGAAGCGAGAATCACACATTACGGAAGCACTTGATCAGCTGAG...

LOC131020006
ATGGGGTTGCCTGATTTGAAAATCAAGAAAAAGGGTAAACAAAAGGTACAACCATCGAAGCGAGAATCACACATTACGGAAGCACTTGATCAGCTGAGAGAGCAAACTAGGGAGGCGGTGAAAGGGTTGGAATCGGTGTCTGGGCCTCGACCCCCAATGGCTGGAGATGGCTTTGGTGGAGACCCGATGATGGAGGATTGGGTCAAGCAGTTTGAGGAGCTTGCAGGCTCACAGGATATGGAGTCAATTGTAGAAACCAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804622.1
MADHSDDIDQLLDSALDDFQSLNLTSSVQRGVDDNGYKNGEGCSLTSGNVQGLGMGLPDLKIKKKGKQKVQPSKRESHITEALDQLREQTREAVKGLESVSGPRPPMAGDGFGGDPMMEDWVKQFEELAGSQDMESIVETMMQQLLSKEILYEPMKEIGERYPTWLEENKGKLTDEEYARYSHQYQFIKDLNQVYEAEPENFNKIVELMQKMQECGQPPNDIVQELAPDFDLSNLGQLSPEMFESQQNCRIM

XP_057804623.1
MGLPDLKIKKKGKQKVQPSKRESHITEALDQLREQTREAVKGLESVSGPRPPMAGDGFGGDPMMEDWVKQFEELAGSQDMESIVETMMQQLLSKEILYEPMKEIGERYPTWLEENKGKLTDEEYARYSHQYQFIKDLNQVYEAEPENFNKIVELMQKMQECGQPPNDIVQELAPDFDLSNLGQLSPEMFESQQNCRIM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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