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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001598`

染色体: Chr04 坐标: 26637388-26639694 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001598`
名称	SmilChr04G001598
描述	U-box domain-containing protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26637388 - 26639694 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020030`
GeneID	`131020030`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020030`
原始查询	`LOC131020030`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 1-like
产物	U-box domain-containing protein 1-like
Arabidopsis	`AT3G46510` (PUB13) plant U-box 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823804] identity=40.9; qcov=0.984; evalue=1.45e-130; confidence=medium
Rice	`Os03g0275900` (OsPUB10) - identity=37.5; qcov=0.975; evalue=6.61e-117; confidence=medium
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0007166 (cell surface receptor signaling pathway); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00514 (Arm); PF04564 (U-box); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF25368 (PUB10_N); PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020030

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804640.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057804640.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057804640.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804640.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804640.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26637555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C19
`Chr4:26637604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42
`Chr4:26637830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B83,C59
`Chr4:26638015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B88
`Chr4:26638291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr4:26638296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C80
`Chr4:26638378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B134,B65,B77
`Chr4:26638489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B98,C80,D10,D11
`Chr4:26639055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B27,B30,C43,C45
`Chr4:26639069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr4:26639487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804640.1

683 aa

342

683

PUB10_N

U-box

zf-RING_UBOX

ARM_PUB

Arm

PF25368 PUB10_N 39-152 aa PF04564 U-box 280-350 aa PF13445 zf-RING_UBOX 286-322 aa PF25598 ARM_PUB 407-675 aa PF00514 Arm 423-460 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804640.1`	Pfam	`PF25368`	PUB10_N	Domain	39	152	6.4e-16	59.8	PUB10-like, N-terminal domain
`XP_057804640.1`	Pfam	`PF04564`	U-box	Domain	280	350	9.2e-23	80.9	U-box domain
`XP_057804640.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	286	322	8.1e-07	29.7	RING-type zinc-finger
`XP_057804640.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	407	675	1.6e-22	81.0	Plant U-box protein ARM repeat region
`XP_057804640.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	423	460	4.8e-25	87.5	Armadillo/beta-catenin-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948657.1
AACAGTCTGTCATAATATTTTATTGTATTGAGATAAATAAAGATTTATTCGAGTTACAATATTCCCCCAAAGAAAGCAAAAGTCATGCAAAAAGAAACGTACACCGACGAACACAACAGCCATGGAACCTCCTCTGATGGTCTCCTCAGGGTTTCTTCCAGCAGCAACGCTGCTGGAATCACTGATCCTTGTCTCCGATGAAGTCGCGTCGGTGGAGAAGGCTCCTCTCCTGCAGAGGAAGAACATCTCAACGATGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020030
ATGGAACCTCCTCTGATGGTCTCCTCAGGGTTTCTTCCAGCAGCAACGCTGCTGGAATCACTGATCCTTGTCTCCGATGAAGTCGCGTCGGTGGAGAAGGCTCCTCTCCTGCAGAGGAAGAACATCTCAACGATGATGAGAAGGATAAGGTTACTGTCCTCGTTGTTCGAGGAGATCCAAGAACAAGTGCAGAAGCAGCCACTCCCACCATCTTCAATGTTGTGCCTCACCGAGCTCTACTCCGTTATTCGAAGGGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804640.1
MEPPLMVSSGFLPAATLLESLILVSDEVASVEKAPLLQRKNISTMMRRIRLLSSLFEEIQEQVQKQPLPPSSMLCLTELYSVIRRVKILIESSVQGSLLWNLMQTESVSNQFYTLVKEMGRALDILPLSLLDLTADTKEQVELLHKQARRAQLYVDHIEAQTRDELIRTAVINSVRNQESKGFVDLIRVRDSLSSIGLNSPAQVEEEISKLEAEAEKQAGTGGLVVVSNINSLISLISISRTAVFSVEENSTTHEDLKKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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