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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001689`

染色体: Chr01 坐标: 31115307-31115858 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001689`
名称	SmilChr01G001689
描述	histone H2B.7
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31115307 - 31115858 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020033`
GeneID	`131020033`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020033`
原始查询	`LOC131020033`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone H2B.7
产物	histone H2B.7
Arabidopsis	`AT3G45980` (HTB9) Histone superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823741] identity=88.7; qcov=1.02; evalue=9.01e-84; confidence=high
Rice	`Os03g0279000` (H2B1) - identity=81.1; qcov=0.892; evalue=8.86e-66; confidence=high
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003677 (DNA binding); GO:0006334 (nucleosome assembly); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00125 (Histone)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020033

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804650.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057804650.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057804650.1`
4	Chromatin	染色质	0.40000	`XP_057804650.1`
5	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057804650.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31115354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B101,B139,B22,C51
`Chr1:31115456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B56,B96,C40
`Chr1:31115468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C13,D5
`Chr1:31115522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:31115528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:31115543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:31115561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr1:31115642`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B108,B140,B16,B42,B48,B54,C24,C76,D6
`Chr1:31115693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804650.1

148 aa

148

Histone

PF00125 Histone 47-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804650.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	47	124	1.5e-20	74.0	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948667.1
ATGGCACCGAAGGCAGAGAAGAAGCCCGCCGAGAAGAAGCCGGCGGAGGAGAAGAAGTCGGTGGTGGCCGAGAAGGCGCCCGCGGCGGAGAAGAAGCCGAAGGCCGGCAAGAAGCTGCCGAAGGACGCCGCCGCCGGCGGAGACAAGAAGAAGAAGAAGGCGAGGAAGAATGTGGAGACATACAAAATCTACATCTTCAAGGTCCTGAAGCAGGTCCATCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCGATGGGGATCATGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020033
ATGGCACCGAAGGCAGAGAAGAAGCCCGCCGAGAAGAAGCCGGCGGAGGAGAAGAAGTCGGTGGTGGCCGAGAAGGCGCCCGCGGCGGAGAAGAAGCCGAAGGCCGGCAAGAAGCTGCCGAAGGACGCCGCCGCCGGCGGAGACAAGAAGAAGAAGAAGGCGAGGAAGAATGTGGAGACATACAAAATCTACATCTTCAAGGTCCTGAAGCAGGTCCATCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCGATGGGGATCATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804650.1
MAPKAEKKPAEKKPAEEKKSVVAEKAPAAEKKPKAGKKLPKDAAAGGDKKKKKARKNVETYKIYIFKVLKQVHPDIGISSKAMGIMNSFINDIFEKLAQESSKLARYNKKPTITSREIQTAVRLVLPGELAKHAVSEGTKAVTKFTSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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