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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001602`

染色体: Chr04 坐标: 26708275-26712482 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001602`
名称	SmilChr04G001602
描述	probable methyltransferase PMT23
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26708275 - 26712482 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020034`
GeneID	`131020034`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020034`
原始查询	`LOC131020034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable methyltransferase PMT23
产物	probable methyltransferase PMT23
Arabidopsis	`AT2G40280` (AT2G40280) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818620] identity=61.1; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0828300` - identity=64.2; qcov=0.862; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005768 (endosome); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0008168 (methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03141 (Methyltransf_29); PF08241 (Methyltransf_11); PF13649 (Methyltransf_25)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020034

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057804649.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804649.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804649.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804649.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804649.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26708566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:26708596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:26709151`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A21,C85
`Chr4:26709151`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A21,C85
`Chr4:26709189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:26709252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr4:26709959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr4:26710004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:26711855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804649.1

602 aa

301

602

Methyltransf_29

Methyltransf_25

Methyltransf_11

PF03141 Methyltransf_29 105-589 aa PF13649 Methyltransf_25 223-315 aa PF08241 Methyltransf_11 224-318 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804649.1`	Pfam	`PF03141`	Methyltransf_29	Family	105	589	7.2e-211	701.9	Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase
`XP_057804649.1`	Pfam	`PF13649`	Methyltransf_25	Domain	223	315	4.4e-10	40.8	Methyltransferase domain
`XP_057804649.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	224	318	2.7e-12	47.9	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948666.1
GATGTAGTTTCTCCATGGCGGGTCCTCATTGATTTGAATATTTTCCCATGTTCAATAAATAGATTTGTTCCTGCCCTGCAGATGCTTTATAATTTATGAACAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAATTCCTCTTATCTCTCTCCATCCCCTCCTCTGTTTATCTCCTCACCAGCCAAAAACCTACTGCAAGTGCAATCCATAATGATGAATAATTAAATAAGAAAATCTGCATCTCTCTCTCTTTCTCTTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020034
ATGGCCGCGTTATCAGTGCCCAGCATCTTAAAAGAGAAGAAATTCCCCTTCGTATTCGCCTTCTTCTTGCTGCTCATACTAGTCACCTTTCTACTCATCTCCAACTCCCAGTCCCCAATCCCCATCGCCACCAATCTCGCCGACCAGCCCGACGCCTTCTCAGCCGTGTCTCCTGACATCACCGCCGCTCCGCCGCCGGCCAACCTCTCTTCGTCAAGCAACGCGGTCGGTAGCCCCCCTCCTGCGGCGGCGGAGGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804649.1
MAALSVPSILKEKKFPFVFAFFLLLILVTFLLISNSQSPIPIATNLADQPDAFSAVSPDITAAPPPANLSSSSNAVGSPPPAAAEAGRVDYQAVEWELCKGGAVDFIPCLDNWNAIKELHSRRHKEHRERHCPDPPPRCLVPLPEGYRVPVPWPKSRDMIWYNNVPHPKLVEYKKDQRWVVKSRNYFVFPGGGTQFKNGVKHYITSIEKMLPAIEFGKKTRIVLDVGCGVASFGGALLDRDVVTMSFAPKDEHEAQIQFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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