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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001608`

染色体: Chr04 坐标: 26771724-26774596 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001608`
名称	SmilChr04G001608
描述	DNA polymerase zeta processivity subunit
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26771724 - 26774596 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020040`
GeneID	`131020040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020040`
原始查询	`LOC131020040`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA polymerase zeta processivity subunit
产物	DNA polymerase zeta processivity subunit
Arabidopsis	`AT1G16590` (REV7) DNA-binding HORMA family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838228] identity=57.4; qcov=1; evalue=3.09e-87; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0016035 (zeta DNA polymerase complex)
KEGG	smil05100 (Bacterial invasion of epithelial cells - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02301 (HORMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804654.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057804654.1`
3	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057804654.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057804654.1`
5	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.20000	`XP_057804654.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26772189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:26772232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr4:26772258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B63,C23
`Chr4:26772290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B118,B93,C24,C25
`Chr4:26772314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,C33,C42,C71
`Chr4:26773049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr4:26773076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:26773079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:26773124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:26774096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B83,C59
`Chr4:26774474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A8,B58,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804654.1

205 aa

102

205

HORMA

PF02301 HORMA 18-112 aa

XP_057804655.1

204 aa

102

204

HORMA

PF02301 HORMA 18-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804654.1`	Pfam	`PF02301`	HORMA	Domain	18	112	5.1e-07	30.0	HORMA domain
`XP_057804655.1`	Pfam	`PF02301`	HORMA	Domain	18	149	2.8e-07	30.9	HORMA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948672.1
AAAAGTTCTATCTTTAATTATAATATTTTAATCAGACCTGAACACAAATACGTACACTTCAACGTCCAGCGACGGGCTTCTGTCTCCCCAAAATGAGCATTCGATATGGAGCGCAAAGACAACCAAACTCCTCAAGGCGAAATCGCGCGGATTCTTGTAGAATTCCTTGAGGTTGCTATTACTTCAGTCGTTTTCCTCAAAGGAGTCTACCCAAATGGGGCTTTTGAGCGGCGGCGATACATGAATTTAGTAGTCCACAA...

XM_057948671.1
AAAAGTTCTATCTTTAATTATAATATTTTAATCAGACCTGAACACAAATACGTACACTTCAACGTCCAGCGACGGGCTTCTGTCTCCCCAAAATGAGCATTCGATATGGAGCGCAAAGACAACCAAACTCCTCAAGGCGAAATCGCGCGGATTCTTGTAGAATTCCTTGAGGTTGCTATTACTTCAGTCGTTTTCCTCAAAGGAGTCTACCCAAATGGGGCTTTTGAGCGGCGGCGATACATGAATTTAGTAGTCCACAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020040
ATGGAGCGCAAAGACAACCAAACTCCTCAAGGCGAAATCGCGCGGATTCTTGTAGAATTCCTTGAGGTTGCTATTACTTCAGTCGTTTTCCTCAAAGGAGTCTACCCAAATGGGGCTTTTGAGCGGCGGCGATACATGAATTTAGTAGTCCACAAAGCCAGGCACCCTCAGCTATATGAATACATTCATGTTGCTGTTAATGGCCTCCTTGCTTTCCTCACCAAGGATTTGATTGATAGAGTAGCTGTGGTTTTCCTGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804654.1
MERKDNQTPQGEIARILVEFLEVAITSVVFLKGVYPNGAFERRRYMNLVVHKARHPQLYEYIHVAVNGLLAFLTKDLIDRVAVVFLDDGGLPIERFVFKLNVNQSYSSKVQQADLEFSLRSFLIKLPLSEPLTKILPPTDCRWEIMAYFRALPQASTSKDAEMWIPSDAKQWQQPAVITPIKSMSSEPLRVQVYAEDPNPSAPKN

XP_057804655.1
MERKDNQTPQGEIARILVEFLEVAITSVVFLKGVYPNGAFERRRYMNLVVHKARHPQLYEYIHVAVNGLLAFLTKDLIDRVAVVFLDDGGLPIERFVFKLNVNQSYSSKVQQADLEFSLRSFLIKLPLSEPLTKILPPNCRWEIMAYFRALPQASTSKDAEMWIPSDAKQWQQPAVITPIKSMSSEPLRVQVYAEDPNPSAPKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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