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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001621`

染色体: Chr04 坐标: 26969345-26975215 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001621`
名称	SmilChr04G001621
描述	U-box domain-containing protein 62-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26969345 - 26975215 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020052`
GeneID	`131020052`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020052`
原始查询	`LOC131020052`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 62-like
产物	U-box domain-containing protein 62-like
Arabidopsis	`AT5G05230` (AT5G05230) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830405] identity=61.1; qcov=0.506; evalue=1.35e-86; confidence=medium
Rice	`Os02g0829600` (OJ1124_D06.12-1) - identity=47.1; qcov=0.426; evalue=5.63e-45; confidence=low
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF04564 (U-box); PF23112 (PUB62-63_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020052

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804675.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804675.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804675.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804675.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804675.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26969499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:26969502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,C59,C84
`Chr4:26969535`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A11,A15,A16,A21,B112,B115,B119,B126,B138,B22,B23,B27,B40,B42,B43,B51,B53,B65,B82,B84,B9,B91,B99,C14,C18,C32,C36,C42,C47,C48,C55,C68,C70,C72
`Chr4:26969543`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A11,B28,B31,B71,B93,C62,C8
`Chr4:26969723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B53
`Chr4:26969861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,D7
`Chr4:26973287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A8,B104,C39,C75
`Chr4:26974174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B53,C57,D7
`Chr4:26975018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804675.1

454 aa

227

454

U-box

PUB62-63_C

PF04564 U-box 277-342 aa PF23112 PUB62-63_C 377-435 aa

XP_057804676.1

453 aa

226

453

U-box

PUB62-63_C

PF04564 U-box 277-342 aa PF23112 PUB62-63_C 376-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804675.1`	Pfam	`PF04564`	U-box	Domain	277	342	1.1e-05	26.2	U-box domain
`XP_057804675.1`	Pfam	`PF23112`	PUB62-63_C	Domain	377	435	3e-35	120.3	U-box protein 62/63 C-terminal
`XP_057804676.1`	Pfam	`PF04564`	U-box	Domain	277	342	1.1e-05	26.2	U-box domain
`XP_057804676.1`	Pfam	`PF23112`	PUB62-63_C	Domain	376	434	3e-35	120.3	U-box protein 62/63 C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948692.1
AATTATCAATACAATTAATGATTTTGAATTATTTTTTAATTAAATTAATCACACCATTGACTGTTTTAAATGCAATCATCAATTTACATAACATGTGTTGAAAGAAAAGAAAAAAGAAGGTGCAGTATCTGTACTCTGTAGTTGACATATGTTCCATCGTTCTTTCCCAACACAAGACGACGTCGTTGATGTTTCCTCACGCCCAATTTCCACAACTCTAACCCTAATCACTCTTCCCAACCTCCAACTCCCACTCAAAA...

XM_057948693.1
AATTATCAATACAATTAATGATTTTGAATTATTTTTTAATTAAATTAATCACACCATTGACTGTTTTAAATGCAATCATCAATTTACATAACATGTGTTGAAAGAAAAGAAAAAAGAAGGTGCAGTATCTGTACTCTGTAGTTGACATATGTTCCATCGTTCTTTCCCAACACAAGACGACGTCGTTGATGTTTCCTCACGCCCAATTTCCACAACTCTAACCCTAATCACTCTTCCCAACCTCCAACTCCCACTCAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020052
ATGTTCCATCGTTCTTTCCCAACACAAGACGACGTCGTTGATGTTTCCTCACGCCCAATTTCCACAACTCTAACCCTAATCACTCTTCCCAACCTCCAACTCCCACTCAAAACCCTAATCTTAATGGCATCTGAAAAGTTGGGGATGGTCCCAACTCAACAAATTCACAACGGACTCAACCAGCATCCTCAGCTAGTTTTCCCAGAAGCTTTCGCCTGCGCCCCGCAGCCGCCGCACCGCCGTCCCGCCGCCACTGGTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804675.1
MFHRSFPTQDDVVDVSSRPISTTLTLITLPNLQLPLKTLILMASEKLGMVPTQQIHNGLNQHPQLVFPEAFACAPQPPHRRPAATGDPGPKAATRELTACFLDHHHYFHPQPQQQQQPPPQPSQFRHQWNANSRSSGGDATEDDDAEDDDDDGDDGDDEEEEEVGNNMENIVTVAKACGSNQKDRYSVTVNSNSHKLKHISALGFKDGNMRQCGNKTNLRSDKSGEVYYSQYLNGAEGPSTSSGQKDIPTAENGCGFSGS...

XP_057804676.1
MFHRSFPTQDDVVDVSSRPISTTLTLITLPNLQLPLKTLILMASEKLGMVPTQQIHNGLNQHPQLVFPEAFACAPQPPHRRPAATGDPGPKAATRELTACFLDHHHYFHPQPQQQQQPPPQPSQFRHQWNANSRSSGGDATEDDDAEDDDDDGDDGDDEEEEEVGNNMENIVTVAKACGSNQKDRYSVTVNSNSHKLKHISALGFKDGNMRQCGNKTNLRSDKSGEVYYSQYLNGAEGPSTSSGQKDIPTAENGCGFSGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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