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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001618`

染色体: Chr04 坐标: 26954229-26965823 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001618`
名称	SmilChr04G001618
描述	uncharacterized SmilChr04G001618
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26954229 - 26965823 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020056`
GeneID	`131020056`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020056`
原始查询	`LOC131020056`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824321]; symbol=AT3G51580; hit=AT3G51580; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824321]; symbol=AT3G51580; hit=AT3G51580; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G51580` (AT3G51580) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824321] identity=37.3; qcov=0.659; evalue=7.19e-20; confidence=low
Rice	`Os05g0478200` - identity=22.4; qcov=0.789; evalue=2.76e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24053 (DUF7356)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020056

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057804680.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057804680.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057804680.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057804680.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057804680.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26954485`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A3,B105,B112,B136,B137,B18,B57,B6,B69,B70,B75,B83,B88,C11,C21,C27,C41,C55,C59,C65,C67,C69,C77
`Chr4:26954531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:26954639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B36,C33,C42
`Chr4:26954648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B135,B62
`Chr4:26954671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr4:26954671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:26954767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B54,D10,D11,D7
`Chr4:26954805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:26955684`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B50,B57,C59,C63,C74
`Chr4:26955684`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B50,B57,C59,C63,C74
`Chr4:26955686`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B52
`Chr4:26955686`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804680.1

232 aa

116

232

DUF7356

PF24053 DUF7356 45-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804680.1`	Pfam	`PF24053`	DUF7356	Domain	45	140	1.9e-20	73.5	Domain of unknown function (DUF7356)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948697.1
CGGATGGTGTTAAGTTGGGGATCAGCTTGTAGAGTTTATTGCACCTCCCATTGGAGGTGCTAAAGAGTTAAATTCCATTTGTTTTGGTTTTGCATCCTTCTTGTATCTCGTTAAAGAGTTAAAAGGCATTTGAAGGATTCAGCGAGTGAGGACATTTTCCTTTGTAATTGCCGCACATCACAATCTATGAGAATGTCGATTTCTCTCCGTCGACTTCGTCCCGCGCTCATTCTTGTTCGTCAACGGGACCCACACGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020056
ATGGAATGTTCAAGGATATCCCTCCTCCTAATTTTCCTGATTTCTGCCGTCCCTCGTCGCTCCCACCAATCATTTGACCACGCGATATCTCCGTCGCCGGCACCACTCCCGTGGACAAGTTCTCCGGCGCCTGAGAGTTTAAATTGCGATCACGTCTCTAACAAGTGTCAAATCCAGAATTGCAGTCTTACTGCCTGCGTGCCTTTTCTTGGATCTCAAACCTTGTATATCGTTATCCTTAATGGTGGTGAGACCTCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804680.1
MECSRISLLLIFLISAVPRRSHQSFDHAISPSPAPLPWTSSPAPESLNCDHVSNKCQIQNCSLTACVPFLGSQTLYIVILNGGETSLQLNIVVLPANMTLDSVVSEHQVKKVDLPSNTRGDSSILLSVGDGECSIHLGSLIPQAFYPSYITPLHGIYILFAATLSIGGSWACCRLAKRRGRLDGVPYHELEMDQRESDQGWGQNWDEEWDDEENGVRSPATIHTRKVPLSSM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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