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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001636`

染色体: Chr04 坐标: 27170629-27173270 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001636`
名称	SmilChr04G001636
描述	uncharacterized SmilChr04G001636
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	27170629 - 27173270 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020065`
GeneID	`131020065`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020065`
原始查询	`LOC131020065`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PLAC8 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820269]; symbol=AT3G10980; hit=AT3G10980; species=arabidopsis; confidence=high
产物	PLAC8 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820269]; symbol=AT3G10980; hit=AT3G10980; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G10980` (AT3G10980) PLAC8 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820269] identity=61.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0474900` - identity=57.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009975 (cyclase activity); GO:0051762 (sesquiterpene biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF04749 (PLAC8); PF11204 (DUF2985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020065

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804692.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057804692.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057804692.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804692.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:27171538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,C83,D10
`Chr4:27171908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B86,B90,B92,C87
`Chr4:27172246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:27172453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:27172556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,C83,D10
`Chr4:27172744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:27172768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C49
`Chr4:27172819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:27172860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr4:27172968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804692.1

563 aa

282

563

DUF2985

PLAC8

PF11204 DUF2985 117-195 aa PF04749 PLAC8 331-461 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804692.1`	Pfam	`PF11204`	DUF2985	Family	117	195	6e-31	107.1	Protein of unknown function (DUF2985)
`XP_057804692.1`	Pfam	`PF04749`	PLAC8	Family	331	461	3.6e-20	73.5	PLAC8 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948709.1
GGAATACAGGAAATACAGCCCCACCTATCAATAGGAGAAACAGGAAGAAAACGAAAATAAAAGCATCCCACTTTAAACTATATTCTTCTTTTTCTTCTCTGGAACTGTACCTCTCCAACCTAAAATCCCAACCTTCACCGGGAATTAATCACATCCAAATGCTTCTCTCTTAATCCGCGCCAATTTCTCTCCGGTATCTTAATTGCCACACTCAAAAAGGGGCAAAAGATTGAGAATGCTTTGGTGGTATTCTTGATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020065
ATGGTTTCAACTGGTAATGGTGAGGATATTGTGGGATGTGAGGAATCGAGTGTGGGTAAAGCCAAGAGTCACGCACCTCTAAACATCTCAACATCACAGAGAGGTCTTATAAACAATGATAACTCGGAGAAAGGGTTTAATGCCGGCTTCTCCGCTATCTCTAAAAAGCTAAGGTTTCTGAAATTTGGTGACTTAGCTTCGCCATCAGCAAGATTCCAGCGGATTGCAGAGGGGAGGGATGAGGTTTCACGCGCTGTACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804692.1
MVSTGNGEDIVGCEESSVGKAKSHAPLNISTSQRGLINNDNSEKGFNAGFSAISKKLRFLKFGDLASPSARFQRIAEGRDEVSRAVPSSSSLHIRERFQRIFSRKMDWNNLGRMGKEWIRDPMNLALFIWIVCVAVSGAILFMVMIGMLNHALPKKSERDAWFEVNNQILNALFTLMCLYQHPKRIYHLALLLRWRQEDILKLRKVYCKNGTYKPHEWAHMMVVVALLNLNCFAQYALCGLNLGYKRSERPAIGVGICIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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