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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000558`

染色体: Chr01 坐标: 11625613-11626821 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000558`
名称	SmilChr01G000558
描述	uncharacterized SmilChr01G000558
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	11625613 - 11626821 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020081`
GeneID	`131020081`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020081`
原始查询	`LOC131020081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020081

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804755.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057804755.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057804755.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057804755.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057804755.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:11625620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C4,C54
`Chr1:11625625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B140,B75,C22
`Chr1:11625662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B79,C17,C41
`Chr1:11625663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C18
`Chr1:11625722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr1:11625724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr1:11625725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B85
`Chr1:11625726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B85
`Chr1:11625738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B129,B38,B39
`Chr1:11625742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr1:11625753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C9
`Chr1:11625794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B39,B77,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804755.1

402 aa

201

402

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 73-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804755.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	73	163	9.5e-06	27.0	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948772.1
ATGCTTGCCAAGGTGAACGTGAATCTGCCCCTCCTGGATGTGATCAGAAAAGTCCCAGCGTATGTGAAGTTTTTTAAGGAGTTAGTCTCCAACAAGCGGAAGTTCGAGGACAATGAGAAGGTTCTGGTCTTAGAAATTGCGAACTCGATCATACAGCAGCCTCTGCCACCAAAGCAACGCGACCCAGGTAGCTTCGTGATTAAAATTGCTTTAGGAAATGGTAAGGAAGCTACGGGAATGTTAGATTTGGGTGCTGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020081
ATGCTTGCCAAGGTGAACGTGAATCTGCCCCTCCTGGATGTGATCAGAAAAGTCCCAGCGTATGTGAAGTTTTTTAAGGAGTTAGTCTCCAACAAGCGGAAGTTCGAGGACAATGAGAAGGTTCTGGTCTTAGAAATTGCGAACTCGATCATACAGCAGCCTCTGCCACCAAAGCAACGCGACCCAGGTAGCTTCGTGATTAAAATTGCTTTAGGAAATGGTAAGGAAGCTACGGGAATGTTAGATTTGGGTGCTGGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804755.1
MLAKVNVNLPLLDVIRKVPAYVKFFKELVSNKRKFEDNEKVLVLEIANSIIQQPLPPKQRDPGSFVIKIALGNGKEATGMLDLGAGINLMPYSIFKQLELGDLKPTRMCLQLADRSVRYPCGIIEDVLVNVGGLIIPVDFVVLDIGEVHENGVEHTLLLGRPFMATTNTLIDVKDGNIKMTVLGESVSFSVHDSRAMPSANFINECSFIDPIDGLVEKVFLQEQECVEVCAGSTDMEELAREAKEFSSPLPSAAPFSSAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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