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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003212`

染色体: Chr04 坐标: 48953395-48956011 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003212`
名称	SmilChr04G003212
描述	uncharacterized SmilChr04G003212
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48953395 - 48956011 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020109`
GeneID	`131020109`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020109`
原始查询	`LOC131020109`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829726]; symbol=AT4G35730; hit=AT4G35730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829726]; symbol=AT4G35730; hit=AT4G35730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G35730` (AT4G35730) Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829726] identity=49.6; qcov=1.05; evalue=4.24e-134; confidence=high
Rice	`Os09g0547200` - identity=73.2; qcov=0.449; evalue=2.38e-103; confidence=low
GO	GO:0015031 (protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF03398 (Ist1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020109

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804765.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057804765.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804765.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804765.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804765.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48953642`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A19,B109,B112,B51,B59,B68,B86,C19,D1
`Chr4:48953737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C56
`Chr4:48953911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B101,C35,D11
`Chr4:48953946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B42,B43,C64,C66
`Chr4:48953986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:48954028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,D10
`Chr4:48954158`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B9
`Chr4:48954158`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B9
`Chr4:48954162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B9
`Chr4:48954162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr4:48954179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr4:48954228`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B121

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804765.1

457 aa

228

457

Ist1

PF03398 Ist1 30-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804765.1`	Pfam	`PF03398`	Ist1	Family	30	194	2.2e-61	207.3	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948782.1
GCCGAAATATCATTCCCAATCCCCACCCGCCACGTCCCTATTAAAATTCCCATTATTCTTTAAATATATAAATAAACAAATTTCCTTTTCTATCCGACCGTTGTACAGCCCTCTTCAGTCGCCACGCTCATTTTCTCCTTACAAAAAACACACAATCTTGTCCAACAAAAAACATGCCAAGCGCCGCCGCCGACCGCTGGAAGAAGGCCGTTGCCATGGGTCTCTCCCTCTTCGGCCGCAGTTTCAACCCCTCCAAATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020109
ATGCCAAGCGCCGCCGCCGACCGCTGGAAGAAGGCCGTTGCCATGGGTCTCTCCCTCTTCGGCCGCAGTTTCAACCCCTCCAAATGCAAAACGTCGGCGAAAATGGCGGTGGCGAGGATAAAGCTGCTGAGAAACAAGAGAGAGGTGGTGATCAGGCAGATCAGGCGCGATATTGCTCTGCTTCTTGAGTCCGGCCAAGATGCCACTGCTCGTATCCGAGTTGAACATGTGATAAGAGAACAGAATATAATGGCAGCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804765.1
MPSAAADRWKKAVAMGLSLFGRSFNPSKCKTSAKMAVARIKLLRNKREVVIRQIRRDIALLLESGQDATARIRVEHVIREQNIMAANELIELFCDLVVARLSIIAKQRECPPDLKEGISSLIFAGPRCSELPELLAIRDVFQKKYGKDFVSAATDLRPNAGVNRLLIEKLSVKTPSGEVKLKVLKEIAKEYQVQWDTTETEEELLKPPEERIEGVNSFVSASGMPLKPVQKPPLESNDASNRGQGNIMNFQDVASAAGVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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