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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001700`

染色体: Chr01 坐标: 31373969-31390122 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001700`
名称	SmilChr01G001700
描述	uncharacterized SmilChr01G001700
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31373969 - 31390122 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020125`
GeneID	`131020125`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020125`
原始查询	`LOC131020125`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coiled-coil protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817335]; symbol=AT2G27900; hit=AT2G27900; species=arabidopsis; confidence=high
产物	coiled-coil protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817335]; symbol=AT2G27900; hit=AT2G27900; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G27900` (AT2G27900) coiled-coil protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817335] identity=60.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0546300` - identity=56; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0032456 (endocytic recycling); GO:0042147 (retrograde transport, endosome to Golgi); GO:1990745 (EARP complex)
KEGG	-
Pfam	PF10474 (Syndetin_C); PF10475 (Vps54_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020125

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057804793.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057804793.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057804793.1`
4	Endosome	内体	0.40000	`XP_057804793.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057804793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31374336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B35,B63,C46
`Chr1:31374474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,C71,C76,C77
`Chr1:31374589`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A23,B101,B103,B122,B13,B131,B138,B139,B2,B22,B47,C51,C56
`Chr1:31374799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:31378043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:31378798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B54,B63
`Chr1:31380761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B6,C47
`Chr1:31380803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:31381218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B113,B25,C61
`Chr1:31382970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:31384077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr1:31384586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804793.1

1125 aa

562

1125

Vps54_N

Syndetin_C

PF10475 Vps54_N 130-420 aa PF10474 Syndetin_C 895-1125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804793.1`	Pfam	`PF10475`	Vps54_N	Repeat	130	420	6.4e-90	302.1	Vacuolar-sorting protein 54, of GARP complex
`XP_057804793.1`	Pfam	`PF10474`	Syndetin_C	Repeat	895	1125	5.8e-73	246.1	Syndetin, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948810.1
GGTCGATAACGAGAAAAATGGAGAAAAAGGAAAGTTGAATAGCGAGAAAAGTACATGAAAAATCTGAATTTTGTTTGGGTGCAGTGAGTTCCCAATTTCTTCCATCAAATTATTGAACTTTTAAGATCCATCGCAGAAAAAGTCTTCACAATCAATCCAAAGTAAACCCATCCTTAAAATTCCATCACCAACGAGATTAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCGCACACACAACACACAGTGACTGCGCGTGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020125
ATGCAGTCGGGCGACAATCCACCGACACTTCCGTTTCCACTCAGTCCGTTGCTGCTCTTGAATGCCGCTGGCGGCGGTCCCGGCGATTTCGGGGAGGGAGGGTTTGAATTGTCGCGGTATTTGTTCCTAGGATCGCTGCTCTTCTCGCGAGAAGCAGGCGGCATGGACTTGTCCAAGGTCGGGGAGAAGATCTTCAGCTCAGTTCGCTCCGCGCGCTCGATTGGTCTCCTGCCTTCCCTGTCTGATCGTCCTGAGGTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804793.1
MQSGDNPPTLPFPLSPLLLLNAAGGGPGDFGEGGFELSRYLFLGSLLFSREAGGMDLSKVGEKIFSSVRSARSIGLLPSLSDRPEVPARAAAAAAVARVLAGLPPHQRHNFSSSDEMSFIYGNKPQGQAVDELEKEFYEEEFDPVRHILEQIPSEENEPAYFEEQAALRLTQLDGISERLSRHVMEHHEQMVHGMNLVRELEKDLKIANVICMNGRRHLTSSRNEVSRDLIVTENSKKKQAFLGMLPILSELRHAVDLQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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