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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003228`

染色体: Chr04 坐标: 49125281-49126559 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003228`
名称	SmilChr04G003228
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49125281 - 49126559 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020128`
GeneID	`131020128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020128`
原始查询	`LOC131020128`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
产物	loganic acid O-methyltransferase-like
Arabidopsis	`AT5G37990` (AT5G37990) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833778] identity=41.5; qcov=1.06; evalue=1.35e-85; confidence=medium
Rice	`Os04g0665200` (IAMT1) - identity=36; qcov=1.06; evalue=1.05e-57; confidence=medium
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0032259 (methylation)
KEGG	-
Pfam	PF03492 (Methyltransf_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020128

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804792.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804792.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804792.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804792.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804792.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49125630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B79,C50
`Chr4:49125648`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B123,B48,C15,C78
`Chr4:49125648`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B123,B48,C15,C78
`Chr4:49125650`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B123,B48,C15,C78
`Chr4:49125650`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B123,B48,C15,C78
`Chr4:49125657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B21,B54,B94,D10
`Chr4:49125663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B123,B48,C15,C78
`Chr4:49125720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:49125800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B123,B27,C15
`Chr4:49126056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B63,C12,C53
`Chr4:49126059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804792.1

339 aa

170

339

Methyltransf_7

PF03492 Methyltransf_7 4-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804792.1`	Pfam	`PF03492`	Methyltransf_7	Domain	4	339	5.2e-104	348.8	SAM dependent carboxyl methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948809.1
AAAACCCGAGAAGTGATGTTATGAAATAGCAAAGTTTTTTATATTAGAAATTCCCAAAGAAGAGAGAGGAAATGGGGGAAAGTTTTCCAATGAAAGGTGGAGATGGTGCTCACAGTTACGCCAAAAACTCCCAATATCAGAAAGAAGCGTCGGATTCGGTGAAGGAAATGATCCGAGAAGTAGTGGTTGAGAAACTAGACACAGAATCAATATCGAGCAGAGTGACGATAGCAGATTTGGGGTGTTCGGTTGGGCCGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020128
ATGGGGGAAAGTTTTCCAATGAAAGGTGGAGATGGTGCTCACAGTTACGCCAAAAACTCCCAATATCAGAAAGAAGCGTCGGATTCGGTGAAGGAAATGATCCGAGAAGTAGTGGTTGAGAAACTAGACACAGAATCAATATCGAGCAGAGTGACGATAGCAGATTTGGGGTGTTCGGTTGGGCCGAACACATTCTTCGCAGTTGAGAATCTGATGGAAGCAGTTGAGACCAAGTCTTGTTCGAAAAACAAGCTGGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804792.1
MGESFPMKGGDGAHSYAKNSQYQKEASDSVKEMIREVVVEKLDTESISSRVTIADLGCSVGPNTFFAVENLMEAVETKSCSKNKLEFQVFFNDHSANDFNTLFASLPADRQYHAAGVPGSFHGRLFPRNSITLAHSSYALQWLSKPPQGVRNEGRIHGLGAPEEVGRAYSDQFEKDLGDFMSARAEEIVSGGLMFLLIPAAPEGVSQTDPTVIFDFYGYTLMDLAKEGVVEKSAIDAFNLPIHMATIGEMRKVVEKNGSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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