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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003238`

染色体: Chr04 坐标: 49175374-49176543 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003238`
名称	SmilChr04G003238
描述	putative germin-like protein 2-1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49175374 - 49176543 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020139`
GeneID	`131020139`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020139`
原始查询	`LOC131020139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative germin-like protein 2-1
产物	putative germin-like protein 2-1
Arabidopsis	`AT3G05950` (AT3G05950) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819765] identity=65.3; qcov=0.983; evalue=4.17e-96; confidence=high
Rice	`Os02g0491600` (OsGLP2-1) - identity=66.8; qcov=0.895; evalue=2.17e-95; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020139

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057804808.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804808.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804808.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804808.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804808.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49175599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:49175646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr4:49175817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,C6
`Chr4:49175844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,D11
`Chr4:49175963`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr4:49175963`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr4:49176010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:49176085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:49176159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B78,B79
`Chr4:49176189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B16,B20,B62,B64
`Chr4:49176192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr4:49176279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804808.1

229 aa

114

229

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 64-216 aa PF07883 Cupin_2 101-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804808.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	64	216	3.5e-51	173.5	Cupin
`XP_057804808.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	101	177	8e-07	29.4	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948825.1
AGTACATGGAGTAGTTACAAGTTAAATGTTAAAACGAGTATTGACGGTTTCGACCCAGAAAATTTCAAATTGAAGATTGCTAGTTAGTTTTTGAGTCCTATAAAAACAAGTACTTGTCATGCTAAGTTTTCCATCACAGATAAAAGAAAAGAAATATAAGTAGGAGTGAAATATATATATCAGATAAGTAAAATGAAGATGGAGTTTGGTTTGTGCACCATTTTTCTTGTTTTGTCGTGGGCTTTGGTTGCATATGCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020139
ATGAAGATGGAGTTTGGTTTGTGCACCATTTTTCTTGTTTTGTCGTGGGCTTTGGTTGCATATGCATCAGATCCAAGCCAGCTTCAGGATTTCTGCGTTGCTGTTCCTGATGCCCAATCTGCTGTTTTTGTGAACGGAAAGTTCTGCAAGAACCCGAACATGGTAGTTGCGGATGATTTCCTTTTCAAGGGTCTAAACAAGGCTGGAAACACTTCAAACGCGGTTGGATCGTTCGTGACTCCGGTGAACGTTAACCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804808.1
MKMEFGLCTIFLVLSWALVAYASDPSQLQDFCVAVPDAQSAVFVNGKFCKNPNMVVADDFLFKGLNKAGNTSNAVGSFVTPVNVNQLAGLNTLGVSMARLDFAPYGINPPHTHPRATEAFLLVEGTLYVGFVTSNPADPNQRNKLFTKYLNPGDVFVFPQGLIHFQFNVGKTKAVAFASFGSQNPGTITIANAVFGSDPKINPDVLARAFQVEKNIIDYLQAQFWSNYN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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