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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001702`

染色体: Chr01 坐标: 31463928-31468910 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001702`
名称	SmilChr01G001702
描述	aspartic proteinase 36-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31463928 - 31468910 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020143`
GeneID	`131020143`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020143`
原始查询	`LOC131020143`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase 36-like
产物	aspartic proteinase 36-like
Arabidopsis	`AT5G22850` (AT5G22850) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832348] identity=67.8; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0777200` (P0413G02.28) - identity=64.2; qcov=0.894; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020143

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804816.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804816.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804816.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804816.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804816.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31464505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr1:31465300`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B16
`Chr1:31465300`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B16
`Chr1:31465303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr1:31465429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B78,C35,C74,D9
`Chr1:31465627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr1:31466727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D10
`Chr1:31466728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C79
`Chr1:31467224`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr1:31467224`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C44
`Chr1:31467398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr1:31467425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804816.1

500 aa

250

500

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 83-268 aa PF00026 Asp 83-438 aa PF14541 TAXi_C 285-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804816.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	83	268	4.5e-43	148.2	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057804816.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	83	438	1.6e-31	110.7	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057804816.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	285	437	2.7e-25	89.7	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948833.1
TAAAATGAAAAATTAAATATTACTCCATATTTCTTCTTAAAAGAAAAAAAGAAAATGAGAAAAAGGGGAGAGAGAAGAAAACAAGTGGCGAAGTATTTCAGTACGGTTAAAAAAGAATCGGAGGATTAAGATTAAGTGATTAACGATATGCGTACAACCTTTTTCAGTTGAACGTACAATCAATCGAAGCGAACAATCTATATCTTTACACAAATACCGCGTAACACAAGTTGATTTTTTCCATTTGAATCAAACTTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020143
ATGCCGCCGGCGAGGATTCTGGTGGCTCAGGCAATTGCGGCGGCGGCGCTACTTTTGGCGATGTCGGTGGGTGGGGAGGGGAAGGGAATGGTGCTGAGCTTGGAGAGGGCGAGTCATGAGGGAGTTGGAATGAGTCAACTCAGGCACCGCGACCGAGTCAGGCACGGTAGATTGTTGCAGCAACAGCCCTCCGGCGTCGTTGATTTTTCCGTCGAAGGCACCTACGATCCTTATCTTGTAGGGCTATATTATACAAGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804816.1
MPPARILVAQAIAAAALLLAMSVGGEGKGMVLSLERASHEGVGMSQLRHRDRVRHGRLLQQQPSGVVDFSVEGTYDPYLVGLYYTRVKLGTPAKEFYVQIDTGSDVLWVSCNPCNGCPTSSGLQIELEFFDPPSSSTASPILCSDQRCALGAQSSDSGCSGQNQCGYTFQYGDGSGTSGYYVYDSMYFDSIVGNSLASNNSAPVVFGCSTSQTGDLTKPDRAVDGIFGFGQQGLSVISQLSSQGITPYSFSHCLRGESGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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