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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003246`

染色体: Chr04 坐标: 49233593-49235499 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003246`
名称	SmilChr04G003246
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49233593 - 49235499 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020148`
GeneID	`131020148`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020148`
原始查询	`LOC131020148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
产物	alpha-1%2C3-arabinosyltransferase XAT3-like
Arabidopsis	`AT3G18180` (AT3G18180) Glycosyltransferase family 61 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821345] identity=42.7; qcov=0.91; evalue=3.94e-117; confidence=medium
Rice	`Os03g0567600` (OsXAT3) - identity=41.5; qcov=0.897; evalue=7.63e-112; confidence=medium
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04577 (Glyco_transf_61)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020148

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057804822.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804822.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804822.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804822.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804822.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49234186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr4:49234222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B48,B60,B65,D4
`Chr4:49234276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B60,B65
`Chr4:49234397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C86
`Chr4:49234477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B48,B60
`Chr4:49234699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr4:49234792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr4:49234867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B110
`Chr4:49235164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:49235173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B81
`Chr4:49235309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B32,B47,B73,C43
`Chr4:49235314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804822.1

497 aa

248

497

Glyco_transf_61

PF04577 Glyco_transf_61 298-403 aa

XP_057804823.1

435 aa

218

435

Glyco_transf_61

PF04577 Glyco_transf_61 235-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804822.1`	Pfam	`PF04577`	Glyco_transf_61	Family	298	403	3.1e-14	54.1	Glycosyltransferase 61
`XP_057804823.1`	Pfam	`PF04577`	Glyco_transf_61	Family	235	341	2.5e-14	54.4	Glycosyltransferase 61

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948839.1
ATGTATACATATATTATATCCACATCGTCTACTTCCCCTTGACTTTTACTAGTATTTAAATTAAAAGAGATATAGCATTAGTAGCACTCCAATTAAGCAAAGATCGACGCTTTCATCACCTCCAAGAAAGAATTGAAGAAGTAAAATTTCATTTCCAAGTAATTAAAAATGTACGATCCCATTTTCGCCAAGAGTTTCAGCCGCTACGATCGCCGACGATTTGGATGTTTCGCTCTCATTCTCTCTCTCATCATCGCGCT...

XM_057948840.1
AATGTACGATCCCATTTTCGCCAAGAGTTTCAGCCGCTACGATCGCCGACGATTTGGATGTTTCGCTCTCATTCTCTCTCTCATCATCGCGCTAAGCATCTGCTCCACTTTCAACCCTACTTTGCATCCTTTGACACTCACTATCGATCAGTGCTGTGGAAAGCATGCTCATAGATGATGCCATTATCAATAATATTACTGCTCAAACAGAAACTGCTCAGAACATGCTTGTGATCAACGAAACTGCAGCCGATATCGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020148
ATGTACGATCCCATTTTCGCCAAGAGTTTCAGCCGCTACGATCGCCGACGATTTGGATGTTTCGCTCTCATTCTCTCTCTCATCATCGCGCTAAGCATCTGCTCCACTTTCAACCCTACTTTGCATCCTTTGACACTCATTGGTGATGCTGTCAATTTGCAGCTATCGATCAGTGCTGTGGAAAGCATGCTCATAGATGATGCCATTATCAATAATATTACTGCTCAAACAGAAACTGCTCAGAACATGCTTGTGATCAA...

LOC131020148
ATGCTCATAGATGATGCCATTATCAATAATATTACTGCTCAAACAGAAACTGCTCAGAACATGCTTGTGATCAACGAAACTGCAGCCGATATCGAGCCACTGATCAGTCCGCAAAGCATGATCGTGATGAAGGAGTCAGAGACGAAACCAGCTAAAATTGATCAAAAGCGGCGGAATGTGGATCCGTTGTGCAGAGTTGTAAAACCAGATGCAGATTACTGCGAGATTGAAGGAGACGTCAGAATCGATCCAAATTCGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804822.1
MYDPIFAKSFSRYDRRRFGCFALILSLIIALSICSTFNPTLHPLTLIGDAVNLQLSISAVESMLIDDAIINNITAQTETAQNMLVINETAADIEPLISPQSMIVMKESETKPAKIDQKRRNVDPLCRVVKPDADYCEIEGDVRIDPNSSTVFLVMPRSTISETNATSNWIIEPYPRRGTGFVKPWTVKLAAEDDASVPKCDHLHSLPALLFSIGGFTGNHFHDFADLLVPLFATSFRFKRDVHFLATDYKPWWPAKYRPL...

XP_057804823.1
MLIDDAIINNITAQTETAQNMLVINETAADIEPLISPQSMIVMKESETKPAKIDQKRRNVDPLCRVVKPDADYCEIEGDVRIDPNSSTVFLVMPRSTISETNATSNWIIEPYPRRGTGFVKPWTVKLAAEDDASVPKCDHLHSLPALLFSIGGFTGNHFHDFADLLVPLFATSFRFKRDVHFLATDYKPWWPAKYRPLLRRLTGHDMLDIDRQNQTHCYTKLTAGLKFDSELVVDSASGVSMRQFRQLLRQTYSLDRDKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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