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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003251`

染色体: Chr04 坐标: 49256655-49259714 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003251`
名称	SmilChr04G003251
描述	11S globulin seed storage protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49256655 - 49259714 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020152`
GeneID	`131020152`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020152`
原始查询	`LOC131020152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	11S globulin seed storage protein 1-like
产物	11S globulin seed storage protein 1-like
Arabidopsis	`AT5G44120` (CRA1) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834435] identity=41.8; qcov=0.996; evalue=7.04e-120; confidence=medium
Rice	`Os10g0400200` (Glua2*) - identity=43.7; qcov=1.04; evalue=5.64e-134; confidence=medium
GO	GO:0045735 (nutrient reservoir activity)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020152

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057804824.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057804824.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057804824.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804824.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804824.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49256811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C18,C78
`Chr4:49256830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr4:49256838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B101,B110,B35
`Chr4:49256847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr4:49256897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A2,B98
`Chr4:49256901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B54,B62,C18,C35
`Chr4:49256919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B43,C77
`Chr4:49256932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,B70,C61,C72
`Chr4:49256936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C86
`Chr4:49256945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,B70,C61,C72
`Chr4:49256955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B43,C77
`Chr4:49256958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,C21,C24,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804824.1

478 aa

239

478

Cupin_1

PF00190 Cupin_1 55-195 aa PF00190 Cupin_1 312-458 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804824.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	55	195	1.9e-62	210.0	Cupin
`XP_057804824.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	312	458	1.9e-62	210.0	Cupin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948841.1
ATGGCTAACATAGCTATCTCCCTCTCTCTCTGCGTGAGCCTCCTCTTCCTCTTCCATGGCTGCCTTGCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGTTCTGGCAGAGCATGCGGTCACAGCAGCAGCACCGCTTCCGCGCCAAGACCCAATGCCAAATCCAGCAGCTCTCCGCCCGCGAGCCCACCTTCCGCTTCCAGTCGGAGGCCGGCGTCAGCGAGTACTGGGACGCCTCCAACGACGAATTCGAGTGCGCCGGCATCGAGTTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020152
ATGGCTAACATAGCTATCTCCCTCTCTCTCTGCGTGAGCCTCCTCTTCCTCTTCCATGGCTGCCTTGCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGTTCTGGCAGAGCATGCGGTCACAGCAGCAGCACCGCTTCCGCGCCAAGACCCAATGCCAAATCCAGCAGCTCTCCGCCCGCGAGCCCACCTTCCGCTTCCAGTCGGAGGCCGGCGTCAGCGAGTACTGGGACGCCTCCAACGACGAATTCGAGTGCGCCGGCATCGAGTTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804824.1
MANIAISLSLCVSLLFLFHGCLAQQQQQQFWQSMRSQQQHRFRAKTQCQIQQLSAREPTFRFQSEAGVSEYWDASNDEFECAGIEFVRHQVQPKGLVLPFYTNAPRLTFIVEGSGILGTVIPGCAETYESEESGSSSRYSGEEGRRGDRHQKLRRFRRGDVIALPEGITTFVYNDGDAPLTYVSMMDIGNDNNQLDFKFRKFLLAGNPESIDRPQGEGRYMRRRGEKEAQETRNVFYGFDEELLAEAFNADPELMRKLQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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