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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000561`

染色体: Chr01 坐标: 11661023-11661772 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000561`
名称	SmilChr01G000561
描述	uncharacterized SmilChr01G000561
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	11661023 - 11661772 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020156`
GeneID	`131020156`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020156`
原始查询	`LOC131020156`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333]; symbol=AT3G51700; hit=AT3G51700; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333]; symbol=AT3G51700; hit=AT3G51700; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51700` (AT3G51700) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333] identity=42.2; qcov=0.98; evalue=8.67e-53; confidence=medium
Rice	`Os07g0255200` - identity=37.2; qcov=0.876; evalue=4.26e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020156

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804862.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804862.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804862.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804862.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804862.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:11661145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C41,C71
`Chr1:11661171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:11661226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C31
`Chr1:11661246`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C12,C31
`Chr1:11661246`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C12,C31
`Chr1:11661374`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B124,B94
`Chr1:11661374`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B124,B94
`Chr1:11661387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B138
`Chr1:11661390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:11661459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr1:11661463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B75,C41
`Chr1:11661505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B138

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804862.1

249 aa

124

249

Pif1_2B_dom

PF21530 Pif1_2B_dom 130-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804862.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	130	176	6.9e-22	77.6	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948879.1
ATGAGACTTGGGAATGCACGTACAATTGACGAGTTCACCAGATTGCAACAATTTGCAAAGTGGATAGCAAGTGTGGGAGATGGGATACTAGGAGGTCCAAATGATGGTGAAGTGGATATTGAGCTTCCAGATGACATTCTCATTAAATATTCAGGAGATCCTATTGCTGCTATAGTCGATGAGATTTATTCATCATTCAGCAGTTGCAGTGACAATCCAACCTATTTGCTGGAACGAGCTATTTTGGCGCCCACACTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020156
ATGAGACTTGGGAATGCACGTACAATTGACGAGTTCACCAGATTGCAACAATTTGCAAAGTGGATAGCAAGTGTGGGAGATGGGATACTAGGAGGTCCAAATGATGGTGAAGTGGATATTGAGCTTCCAGATGACATTCTCATTAAATATTCAGGAGATCCTATTGCTGCTATAGTCGATGAGATTTATTCATCATTCAGCAGTTGCAGTGACAATCCAACCTATTTGCTGGAACGAGCTATTTTGGCGCCCACACTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804862.1
MRLGNARTIDEFTRLQQFAKWIASVGDGILGGPNDGEVDIELPDDILIKYSGDPIAAIVDEIYSSFSSCSDNPTYLLERAILAPTLNVIESINQYMVSLNECEGRQYLNSDKTCTTDSTSSLLHDIHTPEFLNSLKCSGDPNHELYLKVGTPVMLLRDIDHANGLCNGTRLVITRLESHVLEAKVITGHNAGNKVLIPRMSLTPSDPRLPFRFQRKQFPVIVSYAMTIIKQKPRSIINPRWIIFEKTSV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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