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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003254`

染色体: Chr04 坐标: 49281331-49283072 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003254`
名称	SmilChr04G003254
描述	palmitoyl-acyl carrier protein thioesterase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49281331 - 49283072 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020157`
GeneID	`131020157`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020157`
原始查询	`LOC131020157`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	palmitoyl-acyl carrier protein thioesterase, chloroplastic-like
产物	palmitoyl-acyl carrier protein thioesterase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G08510` (FATB) fatty acyl-ACP thioesterases B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837372] identity=50.3; qcov=0.891; evalue=2.09e-105; confidence=high
Rice	`Os11g0659500` - identity=51.5; qcov=0.853; evalue=7.44e-102; confidence=high
GO	GO:0000036 (acyl carrier activity); GO:0006633 (fatty acid biosynthetic process); GO:0016297 (fatty acyl-[ACP] hydrolase activity)
KEGG	smil00061 (Fatty acid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01643 (Acyl-ACP_TE); PF20791 (Acyl-ACP_TE_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020157

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804829.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057804829.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057804830.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804829.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804829.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49281920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804829.1

348 aa

174

348

Acyl-ACP_TE

Acyl-ACP_TE_C

PF01643 Acyl-ACP_TE 76-209 aa PF20791 Acyl-ACP_TE_C 237-340 aa

XP_057804830.1

341 aa

170

341

Acyl-ACP_TE

Acyl-ACP_TE_C

PF01643 Acyl-ACP_TE 76-202 aa PF20791 Acyl-ACP_TE_C 230-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804829.1`	Pfam	`PF01643`	Acyl-ACP_TE	Domain	76	209	8.6e-38	129.7	Acyl-ACP thioesterase N-terminal domain
`XP_057804829.1`	Pfam	`PF20791`	Acyl-ACP_TE_C	Domain	237	340	1.4e-25	90.1	Acyl-ACP thioesterase C-terminal domain
`XP_057804830.1`	Pfam	`PF01643`	Acyl-ACP_TE	Domain	76	202	3.1e-29	102.1	Acyl-ACP thioesterase N-terminal domain
`XP_057804830.1`	Pfam	`PF20791`	Acyl-ACP_TE_C	Domain	230	333	1.5e-25	90.0	Acyl-ACP thioesterase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948846.1
TTGATGCACGCTCCAAATTTAATCCGTATAAAAAGGTTAGGAAATTAATCGTCCAACTCGATTTTCTCCTCCACCCTCAAATAAGTTGTTCACCAGCAAACGCCCATTCCCTCTTTTCACAACACACGTTTCGATTATTTACAATTGGATTAATTTGAGGTATTAATTCTTTCCAATAAGTAGATCACCCACTCCCATCAATTCAAAATTTTCCGCCACCAAAAACAATCCCTCATGTTTGGATTAGCACATTAATCATG...

XM_057948847.1
TTGATGCACGCTCCAAATTTAATCCGTATAAAAAGGTTAGGAAATTAATCGTCCAACTCGATTTTCTCCTCCACCCTCAAATAAGTTGTTCACCAGCAAACGCCCATTCCCTCTTTTCACAACACACGTTTCGATTATTTACAATTGGATTAATTTGAGGTATTAATTCTTTCCAATAAGTAGATCACCCACTCCCATCAATTCAAAATTTTCCGCCACCAAAAACAATCCCTCATGTTTGGATTAGCACATTAATCATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020157
ATGGCTTCCATGCAAAACGCGGCCCTCCGCCTCCGCGAGGATTGCTTCGGGAGGGTGGGCCCTGCCGGTTTAAGCGGCGGCTGGAGGAGGAGGACATGCGTGAAGATGAAGGCGGACGTAAATATGCGGACGAAGAAGCAGGGGATTCAGGTGGCGTTAAGGGAGAAAAGGGAAGCGGAGGCGAATCCCGAGTATCTGCTGGGCGGGTTTGCGGAGGAGCGGTTCGTGTACAGACAACGTTTTGTTATAAGGTCTTACGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804829.1
MASMQNAALRLREDCFGRVGPAGLSGGWRRRTCVKMKADVNMRTKKQGIQVALREKREAEANPEYLLGGFAEERFVYRQRFVIRSYEIGADKTATMETLMNLLQETALNHVSSAGVAGNGFGATREMSIRKLIWVVTRIHVQVDHYSSWGDVVEIDTWVDAAGKNGMRRDWIIRDYDTHTIITRATSTWVIMNRETRRLSKIPDEVRKEVQPFYLNRAAIATHNSDSHKIEKLTDQTAHRIRNGLAPRWSDMDANQHVNN...

XP_057804830.1
MASMQNAALRLREDCFGRVGPAGLSGGWRRRTCVKMKADVNMRTKKQGIQVALREKREAEANPEYLLGGFAEERFVYRQRFVIRSYEIGADKTATMETLMNLLQETALNHVSSAGVAGNGFGATREMSIRKLIWVVTRIHVQVDHYSSWGDVVEIDTWVDAAGKNGMRRDWIIRDYDTHTIITRATRETRRLSKIPDEVRKEVQPFYLNRAAIATHNSDSHKIEKLTDQTAHRIRNGLAPRWSDMDANQHVNNVKYIGWL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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