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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003265`

染色体: Chr04 坐标: 49367338-49371246 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003265`
名称	SmilChr04G003265
描述	SUMO-activating enzyme subunit 1A
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49367338 - 49371246 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020166`
GeneID	`131020166`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020166`
原始查询	`LOC131020166`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SUMO-activating enzyme subunit 1A
产物	SUMO-activating enzyme subunit 1A
Arabidopsis	`AT4G24940` (SAE1A) SUMO-activating enzyme 1A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828596] identity=69.3; qcov=1.05; evalue=2.49e-161; confidence=high
Rice	`Os11g0497000` - identity=60.2; qcov=1.04; evalue=2.87e-137; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016925 (protein sumoylation); GO:0019948 (SUMO activating enzyme activity); GO:0031510 (SUMO activating enzyme complex)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00899 (ThiF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020166

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804835.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804836.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804835.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057804835.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49368252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C37
`Chr4:49369865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:49370044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C32,C68
`Chr4:49370639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C68
`Chr4:49371013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B48,B65,B98,D10
`Chr4:49371037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B75,C73,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804835.1

319 aa

160

319

ThiF

PF00899 ThiF 14-310 aa

XP_057804836.1

302 aa

151

302

ThiF

PF00899 ThiF 14-293 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804835.1`	Pfam	`PF00899`	ThiF	Domain	14	310	4.3e-24	85.7	ThiF family
`XP_057804836.1`	Pfam	`PF00899`	ThiF	Domain	14	293	1e-23	84.4	ThiF family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948852.1
AAAACAATCTTATACATTTAAAAAATAAAAATTGGTAGGCGAGTGACGTCTTTGAAGCCCGCCCTCTCTGAGCTTCTTTGAGTTCATTCATTCCACAAGCATTCAAGCTTTAGGGTTTTCATAGTTCTCTCTCTAAAATTCAATTAGTGCTTTGGGTAATTCAGGCTTCAACTAAACATGGACGGCGAGGAATTGACTGAACAAGAAACCGCGCTTTATGATCGCCAAATTCGCGTTTGGGGCGCCGATGCTCAACGGAG...

XM_057948853.1
TAGGCGAGTGACGTCTTTGAAGCCCGCCCTCTCTGAGCTTCTTTGAGTTCATTCATTCCACAAGCATTCAAGCTTTAGGGTTTTCATAGTTCTCTCTCTAAAATTCAATTAGTGCTTTGGGTAATTCAGGCTTCAACTAAACATGGACGGCGAGGAATTGACTGAACAAGAAACCGCGCTTTATGATCGCCAAATTCGCGTTTGGGGCGCCGATGCTCAACGGAGGCTAAGCAAGTCCCACATACTCGTTAGTGGACTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020166
ATGGACGGCGAGGAATTGACTGAACAAGAAACCGCGCTTTATGATCGCCAAATTCGCGTTTGGGGCGCCGATGCTCAACGGAGGCTAAGCAAGTCCCACATACTCGTTAGTGGACTGAAGGGCTCTGTAGTTGAGTTTTGCAAGAATATTGTGCTTGCCGGGGTAGGTAGTGTGACATTGAACGATGATCGAGTGGTGACGGAGGAATTATTATCTGCTAATTTTTTGGTTCCTTCTGACCCAAATGTATACACGGGGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804835.1
MDGEELTEQETALYDRQIRVWGADAQRRLSKSHILVSGLKGSVVEFCKNIVLAGVGSVTLNDDRVVTEELLSANFLVPSDPNVYTGKSLAELCSDSLKDFNPMVRVEVQQGELSNFGVDFFHKFDAVVISSCSLSTKRSVNEKCRKSLKRIAFYTVDCRDSCGEIFVDLQDYIYTKKKEDEAIECHIEYPTLEEAISAPWKSLPRRVSKLYLALRVIEKFEELEGRSPRETSAADLPKVQRLRKELCDAQSHDESQIPDA...

XP_057804836.1
MDGEELTEQETALYDRQIRVWGADAQRRLSKSHILVSGLKGSVVEFCKNIVLAGVGSVTLNDDRVVTEELLSANFLVPSDPNVYTGKSLAELCSDSLKDFNPMVRVEVQQGELSNFGVDFFHKFDAVVISSCSLSTKRSVNEKCRKSLKRIAFYTVDCRDSCGEIFVDLQDYIYTKEAISAPWKSLPRRVSKLYLALRVIEKFEELEGRSPRETSAADLPKVQRLRKELCDAQSHDESQIPDALLERLLKGRTEFPPVCA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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