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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003267`

染色体: Chr04 坐标: 49379419-49384245 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003267`
名称	SmilChr04G003267
描述	F-box/LRR-repeat protein At5g63520
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49379419 - 49384245 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020168`
GeneID	`131020168`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020168`
原始查询	`LOC131020168`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At5g63520
产物	F-box/LRR-repeat protein At5g63520
Arabidopsis	`AT5G63520` (AT5G63520) F-box/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836471] identity=39.3; qcov=1.01; evalue=2.72e-106; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005515 (protein binding); GO:0032436 (positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08495 (FIST)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020168

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804837.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804838.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057804837.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804837.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804837.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49379634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr4:49379767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:49379779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr4:49381830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr4:49382160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C32,C68
`Chr4:49383689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:49383735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C10
`Chr4:49383856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C70
`Chr4:49383919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804837.1

543 aa

272

543

F-box

FIST

PF00646 F-box 31-68 aa PF08495 FIST 104-323 aa

XP_057804838.1

540 aa

270

540

F-box

FIST

PF00646 F-box 31-68 aa PF08495 FIST 104-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804837.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	31	68	4.4e-08	33.4	F-box domain
`XP_057804837.1`	Pfam	`PF08495`	FIST	Domain	104	323	2.3e-06	28.3	FIST N domain
`XP_057804838.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	31	68	4.3e-08	33.5	F-box domain
`XP_057804838.1`	Pfam	`PF08495`	FIST	Domain	104	320	1.9e-06	28.6	FIST N domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948854.1
ATAACCAATTTAATTTTGTTGGTACCAATCAGCTGTTGGAATTTTGATAACACGTGTTCGAAAGAAAGCATCTCCAAAATTTTCCCTTTGTATCCGCCGTTCACAATTTTGAGCCCTCTTTATTTCTGCCATGGACGAACTTCAATCCTTTCCATCACTGAAGAAAATGTCGAAAGCGAAGGAGAAAACAGGAAGCGGCAGCCAAAATATTGTGGCTACAATCGACGATTTAGGGGACGATCTCATGCAGAACATACTCA...

XM_057948855.1
CAATTTAATTTTGTTGGTACCAATCAGCTGTTGGAATTTTGATAACACGTGTTCGAAAGAAAGCATCTCCAAAATTTTCCCTTTGTATCCGCCGTTCACAATTTTGAGCCCTCTTTATTTCTGCCATGGACGAACTTCAATCCTTTCCATCACTGAAGAAAATGTCGAAAGCGAAGGAGAAAACAGGAAGCGGCAGCCAAAATATTGTGGCTACAATCGACGATTTAGGGGACGATCTCATGCAGAACATACTCACTCGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020168
ATGGACGAACTTCAATCCTTTCCATCACTGAAGAAAATGTCGAAAGCGAAGGAGAAAACAGGAAGCGGCAGCCAAAATATTGTGGCTACAATCGACGATTTAGGGGACGATCTCATGCAGAACATACTCACTCGGTTGCCGGCGCTATCCTTTGCATCGGCGGCGTGCGTTAGTCGCTCCTGGAACTCTCTCTGCCACCGCGTCCTCTCCGTTCCGAAGCTTTGCTCCGCCGTATCTTTTAACCCTACTCTTGAGAATGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804837.1
MDELQSFPSLKKMSKAKEKTGSGSQNIVATIDDLGDDLMQNILTRLPALSFASAACVSRSWNSLCHRVLSVPKLCSAVSFNPTLENAVNEVMDKVLLEPIRPHFVMVSIGPYFCLQAAFQMIEGKFGTRIPVIVNVCEGVIGRNVLTDQFVEVQWEITEEEDHGAELLEEKGGISMTIGFLPGLKVHIVPLLFRNKGPQGILIDDFVMDIKGATSTVSDPASPAGIILFSDRETDINPVLQTLEYALSEDTFIVGGGGCQ...

XP_057804838.1
MDELQSFPSLKKMSKAKEKTGSGSQNIVATIDDLGDDLMQNILTRLPALSFASAACVSRSWNSLCHRVLSVPKLCSAVSFNPTLENAVNEVMDKVLLEPIRPHFVMVSIGPYFCLQAAFQMIEGKFGTRIPVIVNVCEGVIGRNVLTDQFVEVQWEITEEEDHGAELLEEKGGISMTIGFLPGLKVHIVPLLFRNKGILIDDFVMDIKGATSTVSDPASPAGIILFSDRETDINPVLQTLEYALSEDTFIVGGGGCQFLY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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