当前解析结果
SmilChr04G003295| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003295 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003295 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003295 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 49665738 - 49666697 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131020192 |
|---|---|
| GeneID | 131020192 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020192 |
| 原始查询 | LOC131020192 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020192 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057804867.1 |
| 2 | Mitochondrion matrix | 线粒体基质 | 0.40000 | XP_057804867.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057804867.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804867.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057804867.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:49665954 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,C26 |
Chr4:49666009 |
A |
ACT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 44 | A10,A13,A23,A25,A5,A7,B103,B106,B11,B115,B120,B18,B22,B29,B3,B31,B36,B38,B39,B40,B45,B65,B66,B67,B71,B8,B86,B9,C13,C14,C16,C17,C26,C4,C47,C48,C50,C51,C54,C56,C61,C76,C80,D3 |
Chr4:49666232 |
G |
GGT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B75,C40 |
Chr4:49666486 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 22 | A24,B106,B123,B127,B133,B136,B14,B25,B37,B63,B76,B9,B95,C17,C28,C33,C35,C39,C45,C6,C62,C7 |
Chr4:49666498 |
AAG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B108,C15,C51,C77 |
Chr4:49666498 |
AAG |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 4 | B108,C15,C51,C77 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。