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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001754`

染色体: Chr01 坐标: 32265357-32270789 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001754`
名称	SmilChr01G001754
描述	uncharacterized SmilChr01G001754
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32265357 - 32270789 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020208`
GeneID	`131020208`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020208`
原始查询	`LOC131020208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0159200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0159200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G22430` (AT3G22430) RNA recognition motif XS domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821813] identity=31.4; qcov=0.245; evalue=1.41e-35; confidence=weak
Rice	`Os03g0159200` - identity=35.8; qcov=0.25; evalue=6.81e-43; confidence=weak
GO	GO:0031047 (regulatory ncRNA-mediated gene silencing)
KEGG	-
Pfam	PF03468 (XS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020208

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804891.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	0.40000	`XP_057804891.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057804891.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804891.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804891.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32265785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:32265793`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr1:32265793`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr1:32265806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:32265876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B140,B41
`Chr1:32266112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr1:32266220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B99
`Chr1:32266228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B126,B140,B41
`Chr1:32266279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B140,B41
`Chr1:32266370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr1:32266509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:32266577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B118,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804891.1

1041 aa

520

1041

PF03468 XS 881-1006 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804891.1`	Pfam	`PF03468`	XS	Domain	881	1006	6.4e-18	65.8	XS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948908.1
AAAAAACACCAAAATATACAAAATTGAAGATCTAATCTCATTCGCTTTTATTCTCCCAAAAATAAAATAAAAGTGAAAAAAATCTTTCGCTAGAGACTGATTTTCCCAAACATCACAATAACTGCGCTCGAATCTCTATAACCGTATCAGATTGAATCGCGCCGTAGACATGACGCCCCGAAACTGGAAGGTTGGATTTTCCTTTTGATTTGTTGAATAATTTCGGGTTTATGAGGGTTCTAAGGTTCAGGATTTCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020208
ATGATTGGGGGGAGGCGATATCGAGCGGGTTCAATCGGCCGTTCGCCGTCGCCTCGGCGCCCGCCGCCGAGGTCACGGGATTTTAATCCTCCGAGAAATTGGAAGCCGTCGCCATATCGACGGCGTGAGATAGAAGAATATCCAGGGGAGGCTATGCCATCGCGGAGGATTGAAGATAGAGATCATTTTGAGGATAGGGTTTCAAGATTTTCTGAGTATGATGATAGAGATAGGTACAAGAATGGTGGTAGGAGATTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804891.1
MIGGRRYRAGSIGRSPSPRRPPPRSRDFNPPRNWKPSPYRRREIEEYPGEAMPSRRIEDRDHFEDRVSRFSEYDDRDRYKNGGRRFRSPLRIEKVNFDRDRDRDRAVNLSNYGDGAKGDYDNEVSLGVSRRSYHEDSYRGDLSSMKLKWDPPLDGSRKSDNLSWKDYGISRGSNGVGDVNVTSSGDRDYHLQNHYLDSSRAGLPVSQYLDSSVPVSLKYENRGKMHSDSYALARGGVDDLPVGNLSGGDGGGHMSYVASD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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