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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003350`

染色体: Chr04 坐标: 50120070-50121412 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003350`
名称	SmilChr04G003350
描述	uncharacterized SmilChr04G003350
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50120070 - 50121412 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020245`
GeneID	`131020245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020245`
原始查询	`LOC131020245`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF599) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821349]; symbol=AT3G18215; hit=AT3G18215; species=arabidopsis; confidence=high
产物	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF599) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821349]; symbol=AT3G18215; hit=AT3G18215; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G18215` (AT3G18215) transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF599) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821349] identity=65; qcov=1; evalue=1.29e-108; confidence=high
Rice	`Os02g0292800` - identity=52.3; qcov=1.01; evalue=8.04e-79; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04654 (DUF599)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020245

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057804934.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057804934.1`
3	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057804934.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804934.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50120241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C6
`Chr4:50120826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B57,B77
`Chr4:50120904`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr4:50120904`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B118
`Chr4:50120974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804934.1

240 aa

120

240

DUF599

PF04654 DUF599 9-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804934.1`	Pfam	`PF04654`	DUF599	Family	9	212	5e-70	235.9	Protein of unknown function, DUF599

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948951.1
CACCTCATCATAAAGTAAAAGTGCAAAATATATAGTAGTAGAAGGCCTAAGGCATTGAAGTTAAGCAAGAAATGGAGGAAAAGCAACTGGATTCTGTGCTGGTTCCGTTGGGGATGGCCATGTTTCTGGGTTACCACCTTTGGCTTCTCCTCACCATAATACACAACCCTAGAAGAACTGTCATCGGTATCAATTCCCAGAGCCGTCACAAATGGGTCATCTGCTTGATGGCTGATCCACTGAAAAATGGAGTATTGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020245
ATGGAGGAAAAGCAACTGGATTCTGTGCTGGTTCCGTTGGGGATGGCCATGTTTCTGGGTTACCACCTTTGGCTTCTCCTCACCATAATACACAACCCTAGAAGAACTGTCATCGGTATCAATTCCCAGAGCCGTCACAAATGGGTCATCTGCTTGATGGCTGATCCACTGAAAAATGGAGTATTGGCAGTTCAAACGATACGCAACAACATAATGGCGTCGACGCTCTTGGCGACGACGGCCATCACCCTGAGCTCACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804934.1
MEEKQLDSVLVPLGMAMFLGYHLWLLLTIIHNPRRTVIGINSQSRHKWVICLMADPLKNGVLAVQTIRNNIMASTLLATTAITLSSLISVYVSNKSSSPSSKLIYGNKSSFMTSLKFFAILLCFLVAFLCNVQSIRYYAHVSFLATVPTSQGRKDAIEYVARNLNRGSFFWSLGLRAFYLSFPLFLWVFGPIPMFLCCFVMSFLLYFLDTTTNFTRDLHSHSIKQEATVEDVEPVLVHTT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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