当前解析结果
SmilChr01G000562| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000562 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000562 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000562 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 11666755 - 11667102 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020247 |
|---|---|
| GeneID | 131020247 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020247 |
| 原始查询 | LOC131020247 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020247 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057804970.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057804970.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804970.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057804970.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057804970.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:11666777 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B134,C25 |
Chr1:11666798 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,A19,C47 |
Chr1:11666803 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C55 |
Chr1:11666823 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C42 |
Chr1:11666836 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,C55 |
Chr1:11666837 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr1:11666890 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 13 | A10,A14,A16,B121,B45,B50,B57,B6,B79,B85,C10,C7,C73 |
Chr1:11666902 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,A9,B104,B119,B123 |
Chr1:11666938 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B33,B68,C40,C48 |
Chr1:11666959 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C54 |
Chr1:11666964 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B24,B31,B60,B78,B79,C67,C72 |
Chr1:11666992 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | C55,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。