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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003355`

染色体: Chr04 坐标: 50156991-50159744 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003355`
名称	SmilChr04G003355
描述	uncharacterized SmilChr04G003355
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50156991 - 50159744 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020251`
GeneID	`131020251`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020251`
原始查询	`LOC131020251`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger (C2H2 type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826832]; symbol=AT4G12240; hit=AT4G12240; species=arabidopsis; confidence=high
产物	zinc finger (C2H2 type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826832]; symbol=AT4G12240; hit=AT4G12240; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G12240` (AT4G12240) zinc finger (C2H2 type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826832] identity=67.6; qcov=0.711; evalue=2.18e-139; confidence=high
Rice	`Os06g0166200` - identity=48.1; qcov=0.628; evalue=6.32e-67; confidence=high
GO	GO:0004540 (RNA nuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF01936 (NYN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020251

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057804942.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057804942.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804942.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804942.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804942.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50157280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:50157300`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D2
`Chr4:50157300`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D2
`Chr4:50157311`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B59
`Chr4:50157311`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B59
`Chr4:50157315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B117,B53,C57,D1
`Chr4:50157315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B53,C57,D1
`Chr4:50157412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B104,B46
`Chr4:50157463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B87,C36,C59
`Chr4:50157467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:50157495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B46
`Chr4:50157569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804942.1

387 aa

194

387

NYN

PF01936 NYN 219-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804942.1`	Pfam	`PF01936`	NYN	Domain	219	299	1.3e-12	49.2	NYN domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948959.1
ACTCTCACTCTCACTCACAACTCACCTGCCGCCTCAACCATCCCCCATTTCCAGCTCGCCGCTTCCTCAACCGCCGGCCGCCGCCGCCTGTCCTGCACGCCCGCCGCACGCCGCCCTCTCCAGTTCTCTCGCACGCCTCGCCCCTCTGAAGTTCTCCCGCTCGTCGCCCCTCTCGCCTCACGCCCCGCCTGCCGCCTCACTCCCATCTCCGGCCGTCTCCCTCTCCAGTTCGCCCTTCGCCGCCGCCTCACTCACCCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020251
ATGCTCTCAATCCAAGAGCCTCTGATTATGCTGAATCCAACCAAATACCAGACAACTTTCAATAAATTACATTTATACGAAAAGATTCGAGCTTTAGCCCCGTCTTATTCAATTTGTGGATGGAGTAATTTTACCTCAATTTCAAATCAGTATCATGATTCAGAAACTCCACAAGGTTTGGAGCAGAATGTTGCAGATAGAAATGTTGCAATTTTCTGGGATTTGGATAACAAGCCACCGAAATCATTTCCTCCGTATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804942.1
MLSIQEPLIMLNPTKYQTTFNKLHLYEKIRALAPSYSICGWSNFTSISNQYHDSETPQGLEQNVADRNVAIFWDLDNKPPKSFPPYDAALRIKKAAQQFGFVKHMIAYANRHAFSYVPPAIREQRKERKSLNELENKGIVKPDEPYVCKVCGRRFYNNERFLNHFRQIHEREQMKRLNQIESARGKRRLNLVARNAVKMEKYRNAARDILTPKVGYGLADELKRAGFWVKTVSDKPQAADVELRNRMVDMMDRRMVECLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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