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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003359`

染色体: Chr04 坐标: 50190444-50193928 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003359`
名称	SmilChr04G003359
描述	protein SAR DEFICIENT 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50190444 - 50193928 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020256`
GeneID	`131020256`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020256`
原始查询	`LOC131020256`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SAR DEFICIENT 1
产物	protein SAR DEFICIENT 1
Arabidopsis	`AT1G73805` (SARD1) Calmodulin binding protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843716] identity=48.3; qcov=0.947; evalue=9.75e-134; confidence=high
Rice	`Os01g0134700` - identity=46.6; qcov=0.881; evalue=3.06e-114; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005516 (calmodulin binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0080142 (regulation of salicylic acid biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF07887 (Calmodulin_bind); PF20451 (Calmod_bind_M); PF20452 (Calmod_bind_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020256

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804946.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804946.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804946.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804946.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804946.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50190649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B54
`Chr4:50191138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B47,C39,C41
`Chr4:50191166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C50
`Chr4:50191263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:50191310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C50
`Chr4:50191340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:50191394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B76,C10,C16,C40,C58
`Chr4:50191467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:50192789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:50193549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804946.1

455 aa

228

455

Calmodulin_bind

Calmod_bind_M

Calmod_bind_C

PF07887 Calmodulin_bind 91-237 aa PF20451 Calmod_bind_M 249-315 aa PF20452 Calmod_bind_C 321-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804946.1`	Pfam	`PF07887`	Calmodulin_bind	Domain	91	237	2.2e-52	177.8	Calmodulin binding protein-like N-terminal domain
`XP_057804946.1`	Pfam	`PF20451`	Calmod_bind_M	Domain	249	315	1.1e-32	113.1	Calmodulin binding protein central domain
`XP_057804946.1`	Pfam	`PF20452`	Calmod_bind_C	Domain	321	378	1.3e-18	67.6	Calmodulin binding protein C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948963.1
TTACATTTTTCCACGAAACTTCTTACGCGCTTCCTACTTTTACATATTCATATTGAGATGCCCATGCCATGCCCTTTATATTTTTGTCTATAAGTATCCCATTCCACCTCTCTCTTTTTCTCCAAATTCCAACTCTCTCATTTCCTTACCTACATCTATATATATACACAACTTAATTATAAAATTAGATTCTTTCCGAAAATGGCAGCGAAACGATTTTTCGATGGTGATGAGGATCAACCTAACCAGAAACGGATTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020256
ATGGCAGCGAAACGATTTTTCGATGGTGATGAGGATCAACCTAACCAGAAACGGATTAAAATTAGGCCCTCTTTTGCTTCTGTCATCAAAGAAGTCGTTATGGTGAATTTCTTTGAGAATTTCTGCTCAGCTTTGGAACCAATGCTTCGTAGAGTGGTGAGTGAAGAAGTGGAAAATGGGCTGAAGCAGCGTTGCATGGGATTGGGCCCAACCCCAATGCAGCGGTCTCCCTCACTGAAAATGATACGCCACGCGCCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804946.1
MAAKRFFDGDEDQPNQKRIKIRPSFASVIKEVVMVNFFENFCSALEPMLRRVVSEEVENGLKQRCMGLGPTPMQRSPSLKMIRHAPPTASLRLAFVKTLTLPIFTGTKIVDADGGPLQIVLVDHDKVPTSLPHAIKVEIVVVDGDFPAGKDAWSADEFARNIVKERNGKRPLLAGDQLSITMRDGVCFVGDVEFTDNSSWIRSRKFRLAARVVAQHAQAHPPVIQEAVTDPFVVKDHRGELYKKHHPPALEDEVWRLEKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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