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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003365`

染色体: Chr04 坐标: 50235288-50242602 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003365`
名称	SmilChr04G003365
描述	uncharacterized SmilChr04G003365
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50235288 - 50242602 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020261`
GeneID	`131020261`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020261`
原始查询	`LOC131020261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transmembrane Fragile-X-F-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838427]; symbol=AT1G18470; hit=AT1G18470; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transmembrane Fragile-X-F-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838427]; symbol=AT1G18470; hit=AT1G18470; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G18470` (AT1G18470) Transmembrane Fragile-X-F-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838427] identity=75.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0706900` (OsRHC1) - identity=72.1; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10269 (Tmemb_185A); PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020261

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057804952.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057804952.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057804952.1`
4	Endosome	内体	0.20000	`XP_057804952.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804952.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50237225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr4:50237812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B27,C37
`Chr4:50240352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:50240569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B109,D4
`Chr4:50240574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D7
`Chr4:50240680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B135,B24,B28,B53
`Chr4:50240688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr4:50240692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C21
`Chr4:50240844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B27,C37
`Chr4:50240865`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C56
`Chr4:50240865`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C56
`Chr4:50241814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804952.1

467 aa

234

467

Tmemb_185A

zf-C3HC4_3

PF10269 Tmemb_185A 29-292 aa PF13920 zf-C3HC4_3 418-460 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804952.1`	Pfam	`PF10269`	Tmemb_185A	Family	29	292	2.9e-104	349.0	Transmembrane Fragile-X-F protein
`XP_057804952.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	418	460	2.5e-11	43.9	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948969.1
AAAACAACAAGTAACACAATCTCCCAATGAAAAGAGAGCGTGTGGTTCTCTCTGCGCGTGGCTGAAAAGCGACATGGCGGATTAAACCACATTTTACAGTCATTACTACTTTCTTCACCTTCTTCAATATCCGGTGACACAACAGTGGTTTTTAATTCAACTCACTTTCCCTTTGCATTATTATTCAATTTCTAATTTATTGACGTCTCGATTATAGAATTGCAACATCAATGGCGCCTACCGAAACAAAGCTGTTCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020261
ATGATGACATGGAGAAGAGTGGGGAAGTCGTTGCAGGGAGTGACAGCGCACACTTTGCTTTTCTTCTTTACGGTGCTGCTTGTTCTTAAGCTCGATCATACCGTTTCCTACTCTTGGTGGGTTATTTTCTTTCCGCTGTGGCTATTTCATGCAGTTGTTGCACGAGGAAGATTTTCTCTTCCTGCGCCATCAGTTCCTCATGATCGCCATTGGGCCCCATGCCATGCTGTGGTTGCTATGCCGTTGCTTGTTGCATTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804952.1
MMTWRRVGKSLQGVTAHTLLFFFTVLLVLKLDHTVSYSWWVIFFPLWLFHAVVARGRFSLPAPSVPHDRHWAPCHAVVAMPLLVAFELLLCIYLESVYVDHSAAVHLKIVFLPLLAFEVIILIDNFRMCKALLPGDDESMSDEAIWETLPHFWVAISMVFFVAATLFTLLKLCRDVGALGWWDLFINYGIAECFAFLVCTKWSNPVIHRNSQTREESSSSSAIRYLDWNSGLVVSSDDHLQDRICGLQDIGGHIMKIPII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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