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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003371`

染色体: Chr04 坐标: 50276014-50279169 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003371`
名称	SmilChr04G003371
描述	3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50276014 - 50279169 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020268`
GeneID	`131020268`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020268`
原始查询	`LOC131020268`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5
产物	3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5
Arabidopsis	`AT1G06550` (AT1G06550) ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837166] identity=84.6; qcov=0.313; evalue=6.96e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0229000` - identity=81.5; qcov=0.325; evalue=2.2e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16113 (ECH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020268

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057804964.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057804965.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057804965.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057804964.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804962.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50276215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C34
`Chr4:50276233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A3,B111,B36,B49,B6,B63,C2,C21,C25,C69,C71,C73,C79
`Chr4:50276530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C48
`Chr4:50276567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C48
`Chr4:50276567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:50276594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr4:50278153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B32
`Chr4:50278189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804960.1

117 aa

117

ECH_2

PF16113 ECH_2 21-61 aa

XP_057804961.1

117 aa

117

ECH_2

PF16113 ECH_2 21-61 aa

XP_057804963.1

100 aa

100

ECH_2

PF16113 ECH_2 21-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804960.1`	Pfam	`PF16113`	ECH_2	Domain	21	61	5.7e-09	36.6	Enoyl-CoA hydratase/isomerase
`XP_057804961.1`	Pfam	`PF16113`	ECH_2	Domain	21	61	5.7e-09	36.6	Enoyl-CoA hydratase/isomerase
`XP_057804963.1`	Pfam	`PF16113`	ECH_2	Domain	21	61	4.5e-09	37.0	Enoyl-CoA hydratase/isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

13 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100653.1
AAAACTAAATTATAGGCATCTTTTTATAACAAAAAAAAACCTAAATCTCGAACCCTAGTCTTCACTCCATCTGCAATTTCACTCCATCACAATTTCACTCCTTCTGCAATTTCGTGAAATCAATTTCTGACTACTCAATTTTAAGATTTCCCCTTCGCCTCTCTTCCACCGCATCACCAAATCTCAAACCCTAGTCGCTGCTTCTGCTGAAAGCTCGCGGCAATTCGGAGGGGGACGCGCTCCACGCGAACCGCCGCTGC...

XR_009100651.1
TTTATAACAAAAAAAAACCTAAATCTCGAACCCTAGTCTTCACTCCATCTGCAATTTCACTCCATCACAATTTCACTCCTTCTGCAATTTCGTGAAATCAATTTCTGACTACTCAATTTTAAGATTTCCCCTTCGCCTCTCTTCCACCGCATCACCAAATCTCAAACCCTAGTCGCTGCTTCTGCTGAAAGCTCGCGGCAATTCGGAGGGGGACGCGCTCCACGCGAACCGCCGCTGCTCGAGTAGCAAGCACCAGCGGT...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC131020268
ATGGAATTGAGGCATTCGAAATCTCACAGAGCAGTGTTTCTATGTGCCATTTTGGTCAACCCACTTGATATGGCTAAGGTTGCGCTAGTTCATGGGATTTCCATGGGTGAAGGTGCATCCTTAATGGTCCCAATGAAGTTCTCTGTTGTCACAGAGAAAAGTAAAGACCTCGAAACCAAGATTGAGAAGTCGAGGAAGCAGATAAAAGAATGCAAAAACAGAGCAAAGAAAATCTGTGGTGTCAAGAAGATTTCATTCCG...

LOC131020268
ATGGAATTGAGGCATTCGAAATCTCACAGAGCAGTGTTTCTATGTGCCATTTTGGTCAACCCACTTGATATGGCTAAGGTTGCGCTAGTTCATGGGATTTCCATGGGTGAAGGTGCATCCTTAATGGTCCCAATGAAGTTCTCTGTTGTCACAGAGAAAAGTGGTTTTGCAACTCCGGAGAAAGACCTCGAAACCAAGATTGAGAAGTCGAGGAAGCAGATAAAAGAATGCAAAAACAGAGCAAAGAAAATCTGTGGTGT...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057804960.1
MELRHSKSHRAVFLCAILVNPLDMAKVALVHGISMGEGASLMVPMKFSVVTEKSGFATPEKDLETKIEKSRKQIKECKNRAKKICGVKKISFRVLTDGSLDGWIAFDLKLLQSIIFR

XP_057804961.1
MELRHSKSHRAVFLCAILVNPLDMAKVALVHGISMGEGASLMVPMKFSVVTEKSGFATPEKDLETKIEKSRKQIKECKNRAKKICGVKKISFRVLTDGSLDGWIAFDLKLLQSIIFR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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