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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003377`

染色体: Chr04 坐标: 50327168-50329338 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003377`
名称	SmilChr04G003377
描述	peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50327168 - 50329338 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020275`
GeneID	`131020275`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020275`
原始查询	`LOC131020275`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial-like
产物	peptidyl-tRNA hydrolase%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G18440` (AT1G18440) Peptidyl-tRNA hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838424] identity=71; qcov=0.811; evalue=3.31e-110; confidence=high
Rice	`Os01g0693900` - identity=78.5; qcov=0.753; evalue=7.19e-113; confidence=high
GO	GO:0004045 (peptidyl-tRNA hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01195 (Pept_tRNA_hydro)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020275

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804972.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057804972.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804972.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804972.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804972.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50327415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B119,C20
`Chr4:50327415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C20
`Chr4:50327533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B72,C12
`Chr4:50327554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B52,B64,B82,C55
`Chr4:50327565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,C20,D11
`Chr4:50327580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C12
`Chr4:50327690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B28,B30,C49
`Chr4:50327693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B72,C12
`Chr4:50328387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:50328933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:50328954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C85
`Chr4:50329074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B52,B64,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804972.1

259 aa

130

259

Pept_tRNA_hydro

PF01195 Pept_tRNA_hydro 68-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804972.1`	Pfam	`PF01195`	Pept_tRNA_hydro	Domain	68	254	4.9e-68	229.4	Peptidyl-tRNA hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948989.1
TTTGCCTCAAAAGAAAATGCCAAATGCGCGTGAAATAATGTTCGGTATATCTGCTGGCTTATTTCCTCGGTCTCCAACGGCGGCTGCAATTGGGCGGCGCCGCCTCCTTTCTGAATCCTCCTTTTCCATTCCGTGGTGGTATAATAACAAAAGTGGATTAAGATTGAAGGCAATGGCCTCAATTTCGACAGATGTAGAAAAACCCCGGAAACCCTGGCTTTTCGTTGGCCTCGGCAACCCCGGGAAGCGCTACAGCGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020275
ATGCCAAATGCGCGTGAAATAATGTTCGGTATATCTGCTGGCTTATTTCCTCGGTCTCCAACGGCGGCTGCAATTGGGCGGCGCCGCCTCCTTTCTGAATCCTCCTTTTCCATTCCGTGGTGGTATAATAACAAAAGTGGATTAAGATTGAAGGCAATGGCCTCAATTTCGACAGATGTAGAAAAACCCCGGAAACCCTGGCTTTTCGTTGGCCTCGGCAACCCCGGGAAGCGCTACAGCGGCACTCGCCACAATGTGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804972.1
MPNAREIMFGISAGLFPRSPTAAAIGRRRLLSESSFSIPWWYNNKSGLRLKAMASISTDVEKPRKPWLFVGLGNPGKRYSGTRHNVGFELIDYIAEAEGISTGSISFKSAFGKGFIGDVPVMLAKPQTFMNASGESVGALVSYYKIPLDQVLVMFDDIDLPFAKLRLLPKGGHGGHNGMRSIITHLKGSRDFPRLRIGIGRPPGKMDAASFVLRPFNREEREELDFTFQNGLEAVRILVQQDFNRSATFVNSAKSLHTL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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