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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003379`

染色体: Chr04 坐标: 50330508-50342976 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003379`
名称	SmilChr04G003379
描述	DENN domain and WD repeat-containing protein SCD1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50330508 - 50342976 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020276`
GeneID	`131020276`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020276`
原始查询	`LOC131020276`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DENN domain and WD repeat-containing protein SCD1-like
产物	DENN domain and WD repeat-containing protein SCD1-like
Arabidopsis	`AT1G49040` (SCD1) stomatal cytokinesis defective / SCD1 protein (SCD1) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841327] identity=69.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0575500` (OsWD40-16) - identity=69.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0031410 (cytoplasmic vesicle); GO:0032483 (regulation of Rab protein signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF02141 (DENN); PF03456 (uDENN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020276

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804973.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057804973.1`
3	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.60000	`XP_057804973.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057804973.1`
5	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057804973.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50331505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr4:50334434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:50338184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B76,C16,D5
`Chr4:50338658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:50341320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:50341453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:50342276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,C24,C27,C78,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804973.1

1194 aa

597

1194

uDENN

DENN

WD40

PF03456 uDENN 36-103 aa PF02141 DENN 123-305 aa PF00400 WD40 835-883 aa PF00400 WD40 890-925 aa PF00400 WD40 932-966 aa PF00400 WD40 1013-1048 aa PF00400 WD40 1052-1089 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804973.1`	Pfam	`PF03456`	uDENN	Domain	36	103	6e-12	46.6	uDENN domain
`XP_057804973.1`	Pfam	`PF02141`	DENN	Family	123	305	1.9e-43	149.2	DENN (AEX-3) domain
`XP_057804973.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	835	883	1.3e-31	108.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057804973.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	890	925	1.3e-31	108.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057804973.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	932	966	1.3e-31	108.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057804973.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	1013	1048	1.3e-31	108.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057804973.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	1052	1089	1.3e-31	108.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948990.1
CGTTTACTCTTTCAAACAAAACAGATTCCGCTTGCATTTGCATTTGGCAAGGCAACGATGCAACACTCCAACTTCCATTTCTCCACCAGCTGAAATTTCTTCTCTCTAATTTCACCTCTCCTGCAACCAGATCATCAATCTCACTCCATCACAACAACTTTCAGATCACCATGCAATACAACCGCTGCGCTCAACCAATTTGATTTGCTCCAAATCCGCGTCCTAGTTCCCAATCCGAACCACCAATGCCGCCGATCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020276
ATGCCGCCGATCTTCGAGTACTTCGTCGTGTGCGGAATGGGACCGGAAATCCGCACCCTCGACGGCGTCCGCGGCTACCACGGCATGACCACCATGTACCTGTCGTCGCTGCTCGACCAATACCCTCCCTCCAATCACGCTCTCTATCCGCCGCCGCCGCCGCAGCTCTCCACCTGCGTCTTGCCTGCCGGCGTCCAATTCTACTCGTCGGGGTTCAGTTCCGAAGATCCGTCGTCGTTCCCGCGCAATTACCCTATCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804973.1
MPPIFEYFVVCGMGPEIRTLDGVRGYHGMTTMYLSSLLDQYPPSNHALYPPPPPQLSTCVLPAGVQFYSSGFSSEDPSSFPRNYPIVLTEGDGSKIYVSCIAFRDPVDEDIAEAFRIPPGSFADKCICLVSRSPSFRILRETLEEIFLLCFSTSGSSMPLWEIVAFLVSNVPLPTPGKERVFFTIENGLLAIDVPPKDGLPHADISFQPLVQCLDVDNLIKLFTAVLLERRILLRSDKYSLLTLVSEAICHLIYPFRWQH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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