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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003391`

染色体: Chr04 坐标: 50458881-50461772 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003391`
名称	SmilChr04G003391
描述	uncharacterized SmilChr04G003391
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50458881 - 50461772 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020287`
GeneID	`131020287`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020287`
原始查询	`LOC131020287`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA ligase (DUF1666) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843721]; symbol=AT1G73850; hit=AT1G73850; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DNA ligase (DUF1666) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843721]; symbol=AT1G73850; hit=AT1G73850; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G73850` (AT1G73850) DNA ligase (DUF1666) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843721] identity=62; qcov=0.647; evalue=1.96e-136; confidence=high
Rice	`Os01g0129500` - identity=56; qcov=0.65; evalue=8.95e-118; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07891 (DUF1666)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020287

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057804991.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057804991.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057804991.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804991.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804991.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50459700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:50460299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B82
`Chr4:50460546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77
`Chr4:50460701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B75,C73,C74
`Chr4:50460789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:50460791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B78,B79
`Chr4:50460818`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B62
`Chr4:50460818`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B62
`Chr4:50460821`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B62
`Chr4:50460821`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B62
`Chr4:50460873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr4:50460918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804991.1

569 aa

284

569

DUF1666

PF07891 DUF1666 327-567 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804991.1`	Pfam	`PF07891`	DUF1666	Family	327	567	3.7e-91	305.9	Protein of unknown function (DUF1666)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949008.1
CCAACTTTGAATTGCTTTATACAAAGATAAGTGGAGAGCCCATATCTCTTAGGACAAAGGAATTAAGAAAATGCTTATCATTCAATCTCCAAATCCAATTCCAATACAAACATTTGCTACACTTTTCTATAATCTATCTTCCTCTCTCTTCCTTATCTTCATCTTCTTCCACTTCACCTCCATTTTTCTTGCCAAATTGTTCATCTTCTTCGGCGGCAATCCCTTCTTCCAAAGGAATCAAGACGGATACGAATTCGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020287
ATGCTTATCATTCAATCTCCAAATCCAATTCCAATACAAACATTTGCTACACTTTTCTATAATCTATCTTCCTCTCTCTTCCTTATCTTCATCTTCTTCCACTTCACCTCCATTTTTCTTGCCAAATTGTTCATCTTCTTCGGCGGCAATCCCTTCTTCCAAAGGAATCAAGACGGATACGAATTCGCCACCTTCTCCGACGAGGAAGTTGAAGAAGAGAATGACGACTACTACGCCACCGCCGTTAAGCAGGTTGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804991.1
MLIIQSPNPIPIQTFATLFYNLSSSLFLIFIFFHFTSIFLAKLFIFFGGNPFFQRNQDGYEFATFSDEEVEEENDDYYATAVKQVDGAAAAFVNPHEPFDQDILVDDGDSDESGYATPPSENYNYDDDDEEEEEEEEEEEEEILARDTDSSYDSETNETGPTTRFRETSFAPTNNVDINHIHQAPAAEKIEMSLRKEEKYLVFQSEGKKLVREDDEREMFGDSFNMGSTSKDSSEWRSSINCRDSATEDPFSSSSRRSCP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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