当前解析结果
SmilChr04G003418| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003418 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003418 |
| 描述 | protein transport protein sec31-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 50775936 - 50778821 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131020288 |
|---|---|
| GeneID | 131020288 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020288 |
| 原始查询 | LOC131020288 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein transport protein sec31-like |
| 产物 | protein transport protein sec31-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020288 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057804992.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057804992.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804992.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057804992.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057804992.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:50777172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,B28,C32,C68 |
Chr4:50777362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C50 |
Chr4:50777446 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,B46,B70,D2 |
Chr4:50777538 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B36,C11,C69 |
Chr4:50777979 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,C76 |
Chr4:50778264 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C26 |
Chr4:50778471 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C38 |
Chr4:50778761 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 103 | A1,A10,A14,A16,A18,A21,A22,A23,A25,A3,A5,A6,A9,B1,B102,B103,B111,B118,B119,B12,B121,B124,B126,B127,B128,B129,B132,B133,B134,B139,B16,B21,B22,B26,B27,B29,B34,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B45,B46,B48,B53,B55,B56,B60,B64,B66,B67,B7,B70,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B84,B85,B89,B96,B97,B98,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C26,C33,C34,C39,C42,C43,C44,C52,C55,C57,C6,C60,C64,C66,C67,C71,C72,C79,C84,C86,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。