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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003398`

染色体: Chr04 坐标: 50511428-50514953 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003398`
名称	SmilChr04G003398
描述	rhamnogalacturonan I rhamnosyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50511428 - 50514953 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020291`
GeneID	`131020291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020291`
原始查询	`LOC131020291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhamnogalacturonan I rhamnosyltransferase 1-like
产物	rhamnogalacturonan I rhamnosyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT5G15740` (AT5G15740) O-fucosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831430] identity=74; qcov=0.956; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0284200` - identity=77.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF10250 (O-FucT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057804999.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057804999.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804999.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804999.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50511756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B135,C85
`Chr4:50512492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C2
`Chr4:50512583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:50512612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr4:50512754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B64,C2,C55,C71,D4
`Chr4:50513395`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr4:50513395`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr4:50513921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C2
`Chr4:50513935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:50514055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804999.1

496 aa

248

496

O-FucT

PF10250 O-FucT 94-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804999.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	94	414	3.4e-105	353.2	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949016.1
TGCATATACAATATTTTGAGTGCAAACCAGCATTTACCATTTACACAATATTTATGAATAGCAAAAATTACAGCTTAAAATGTAGGAAGAAGATGCAATTCACTGCCACCGGAGCGGATGTAATAAATGGATGTATACAAATGGAATGGGGACCTCAGCTCGGCTAGCATAGCATCATCACTCACACACCTCCGTACAAATTCGTATGTGTGTATAATGTGCGTATTTCTCGGATAATATTTCTTGGACAATGCGAGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020291
ATGATGGGGCACAAAACGGCGGCGTTTGGAGGGGAGAGGCTGAGGAATACTGGGTTGGTGTCACGGTCGAGAGTGAAGCTATGGATGATCAGAGCAACCACCACGATTTTGTTGTGGACTTGTGTAGTTCAGTTGACGGCATTGAGCGAAACTTGGGGGCCTCGCGTCTTGAAAGGCTGGCCCTCTTGCTTCTTGCACGAACCCGATACTGCTGCCCTCGCCTTGAGCCGCCTCCCTGTTACAACTCCTCCACCCAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804999.1
MMGHKTAAFGGERLRNTGLVSRSRVKLWMIRATTTILLWTCVVQLTALSETWGPRVLKGWPSCFLHEPDTAALALSRLPVTTPPPKRVYKNNGYLMVSCNGGLNQMRAAICDMVTIARSLNVTLIVPELDKTSFWNDPSEFQDIFDVDHFITSLRDEVRILKELPPRVKSRVELGIIHTMPPISWSDISYYHNQVLPLIQRYKVVHLNRTDARLANNGQPLEIQRLRCRVNFSALRFTPQIEELGRKVIKILRQNGPFLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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