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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003413`

染色体: Chr04 坐标: 50755390-50763192 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003413`
名称	SmilChr04G003413
描述	transcription termination factor MTERF15, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50755390 - 50763192 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020294`
GeneID	`131020294`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020294`
原始查询	`LOC131020294`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription termination factor MTERF15, mitochondrial
产物	transcription termination factor MTERF15%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G74120` (AT1G74120) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843752] identity=50.4; qcov=0.952; evalue=4.5e-146; confidence=high
Rice	`Os12g0490000` - identity=45.2; qcov=0.52; evalue=1.47e-56; confidence=medium
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020294

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057805004.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057805004.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805004.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805004.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805004.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50761761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:50761961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,D7
`Chr4:50761996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,C5,C80,D2
`Chr4:50762074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B54,C50,C70,C85
`Chr4:50762311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B54,C50,C70,C85
`Chr4:50762338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:50762397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B76,B95,C45,C7
`Chr4:50762633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,D7
`Chr4:50762670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:50762730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C32,C68
`Chr4:50762838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B44,B6,C67
`Chr4:50762927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B46,B70,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805004.1

442 aa

221

442

mTERF

PF02536 mTERF 36-254 aa PF02536 mTERF 284-382 aa

XP_057805005.1

442 aa

221

442

mTERF

PF02536 mTERF 36-254 aa PF02536 mTERF 284-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805004.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	36	254	2.2e-38	132.7	mTERF
`XP_057805004.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	284	382	2.2e-38	132.7	mTERF
`XP_057805005.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	36	254	2.2e-38	132.7	mTERF
`XP_057805005.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	284	382	2.2e-38	132.7	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949022.1
AATTGTAATTTTACAAATATACGAGCTCAATCTCCAATTTGGAAATTTCCCTTCCCAACTAAATGAGTCCAAATAAAAGTGCAATTCCAAACCCTCGCTTCCATCTCTTCAACGTTAAGTTCAGGCAAGAGCTGCAATGATAACCCAAAAATGGCTATTCGCATTAAACCCTTGTATCATTACATCGCAAATTCATCAATTTCCTTCCCGAATCTGTTATCCCGATCTCTCTCCACAACTTCTCCATCCCATCACGAAAA...

XM_057949021.1
ATTTTACAAATATACGAGCTCAATCTCCAATTTGGAAATTTCCCTTCCCAACTAAATGAGTCCAAATAAAAGTGCAATTCCAAACCCTCGCTTCCATCTCTTCAACGTTAAGTTCAGGCAAGAGCTGCAATGATAACCCAAAAATGGCTATTCGCATTAAACCCTTGTATCATTACATCGCAAATTCATCAATTTCCTTCCCGAATCTGTTATCCCGATCTCTCTCCACAACTTCTCCATCCCATCACGAAAATCCGACT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020294
ATGGCTATTCGCATTAAACCCTTGTATCATTACATCGCAAATTCATCAATTTCCTTCCCGAATCTGTTATCCCGATCTCTCTCCACAACTTCTCCATCCCATCACGAAAATCCGACTCCCCTCTGCAATCTCTTCCGGAGGTATGGCTTCCCGCCGAGCGAGCTCCCCAATTTTCTCAAAAAGAATGAATTTATACAGAATTCAGCTCCCCGAGAAATAGAAAATTATTTCAAGATCTTGCTGTCGTTAAACCCCTCTCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805004.1
MAIRIKPLYHYIANSSISFPNLLSRSLSTTSPSHHENPTPLCNLFRRYGFPPSELPNFLKKNEFIQNSAPREIENYFKILLSLNPSREFLVSTVTSCPRVLQLSLLETWKYGINQLGIRNISSIATCNILELVSKFGLSPNDVSRRVGCLKSLGFSEATVIRVLENVPMAIMSVDDELHDKVEFLMGIGIRRSEIDRVIRLYPRILAFGVEKRLKPLLDEFGDLGFSLSDVRREVVREPQVLGLENGELSHCLEMLRSLK...

XP_057805005.1
MAIRIKPLYHYIANSSISFPNLLSRSLSTTSPSHHENPTPLCNLFRRYGFPPSELPNFLKKNEFIQNSAPREIENYFKILLSLNPSREFLVSTVTSCPRVLQLSLLETWKYGINQLGIRNISSIATCNILELVSKFGLSPNDVSRRVGCLKSLGFSEATVIRVLENVPMAIMSVDDELHDKVEFLMGIGIRRSEIDRVIRLYPRILAFGVEKRLKPLLDEFGDLGFSLSDVRREVVREPQVLGLENGELSHCLEMLRSLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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